RNA-seq:RNA-seq是一种第二代测序技术,主要包括Illumina HiSeq和NextSeq等。RNA-seq通过将RNA反转录成cDNA,然后进行扩增和测序,获取RNA的片段序列信息。 2.应用范围: 三代全长转录组测序:由于可以直接测序RNA的全长,三代测序技术在研究转录本的全长变异、剪接异构体和RNA修饰等方面具有优势。它可以提供更全面和准...
转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
转录组测序(transcriptome sequencing)是一种利用高通量测序技术来研究转录组的方法,也就是说,它可以用来测定一个特定生物或细胞类型的所有RNA分子。而RNA测序(RNA-seq)是转录组测序的一种,是一种利用深度测序技术特异性地研究转录组中的mRNA(信使RNA)水平的方法。
广泛使用的 Illumina 测序平台采用基于可逆染料终止子的合成测序方法。另一项即将推出的技术 SOLiD 测序(寡核苷酸连接和检测测序)采用基于连接的方法,使用可逆终止子来确定 DNA 序列。这些第二代测序技术显着提高了DNA测序的通量和速度,使其在基因组学研究和临床诊断中得到广泛应用。这些平台实现了全基因组测序、转录组...
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术 (NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(...
Full-length RNA-seq from single cells using Smart-seq2 7 单细胞转录组 单细胞测序分为低通量单细胞测序,和海量单细胞测序,低通量测序就如上边的smartseq 2 的技术,当细胞非常少的时候可以看不同细胞之间的差异性,如果当细胞很多时候我们想研究很多个细胞中每个细胞的基因表达量的时候可以做海量单细胞测序,海量...
除了传统的 mRNAseq 测序,目前又逐渐开发除了其他非编码 RNA 的测序,包括长链非编码RNA(LncRNA) 测序,小 RNA (Small RNA),环状 RNA(circRNA)以及全转录组测序,单细胞转录组测序,转录调控因子测序,蛋白质组学测序,代谢组学测序等。 二、RNAseq 研究 10 年 ...
RNA测序(RNA-seq)在过往十年里逐渐成为全转录组水平分析差异基因表达和研究mRNA差异剪接必不可少的工具。随着二代测序技术 (NGS)的发展,RNA-seq的应用也越来越广。现已经可以应用于很多RNA层面的研究,比如单细胞基因表达、RNA翻译(translatome)和RNA结构组(structurome结构组学)。新的有意思的应用,如空间转录组学(...
三代全长转录组测序与 RNA-seq 在技术原理和数据类型上有显著区别。RNA-seq 通常采用二代测序技术(如 Illumina),生成短序列片段,需要拼接和基因注释来重构转录本,而三代全长转录组测序使用第三代技术(如 PacBio 或 Oxford Nanopore),能够直接测序较长的 RNA 分子,获得完整的转录本。由于三代测序直接提供完整的...