转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
一、RNA-seq原理 RNA-seq的原理基于测序技术,通过将RNA样本转录成cDNA,然后进行高通量测序,最后利用计算方法分析测序结果。具体步骤如下: 1. RNA提取:从细胞或组织中提取总RNA,包括mRNA、rRNA、tRNA等各种类型。 2. RNA片段化:将提取的RNA进行片段化处理,通常采用酶或碱性水解等方法。 3. cDNA合成:利用反转录酶...
rna-seq原理 RNA-seq(RNA序列)是一种用于检测和测量转录组中的RNA分子数量和种类的高通量测序技术。与传统的微阵列技术相比,RNA-seq能够提供更高的分辨率和更广泛的检测范围,因此已成为了转录组学研究的常用技术之一、RNA-seq的原理基于第二代测序技术,包括Illumina HiSeq、Ion Torrent PGM和Roche 454等。 RNA-...
二、RNA-seq技术原理 Illumina/Solexa测序技术的基本原理是边合成边测序,即测序过程是以DNA单链为模板,在生成互补链时,利用带荧光标记的dNTP发出不同颜色的荧光来确定不同的碱基。新加入dNTP的末端被可逆的保护基团封闭,既保证单次反应只能加入一个碱基,又能在该碱基读取完毕后,将保护基团除去,使得下一个反应可继续...
rna seq原理 RNA-Seq是一种高通量测序技术,用于分析和揭示细胞和组织中存在的RNA分子的种类和量。它通过将RNA分子转化为可逆转录的DNA(cDNA),然后使用高通量测序技术对cDNA进行测序。 RNA-Seq的工作流程如下:首先,从细胞或组织中提取RNA分子,并对RNA进行纯化和酶解,以去除可能存在的DNA和蛋白质污染物。接下来,...
rna-seq基本原理 RNA-seq(RNA测序)是一种通过测定RNA分子在特定条件下的表达水平来研究基因表达的技术。其基本原理如下: 1. RNA提取:首先从生物样品中提取总RNA,包括所有转录本的mRNA、rRNA和tRNA等。RNA提取的方法可以根据研究目的和样品的特性选择合适的方法。 2. RNA逆转录:将提取的总RNA经过逆转录反应,将RNA...
【解析】利用高通量测序技术对转录组进行测序分析,对测序得到的大量原始读长(reads)进行过滤、组装及生物信息学分析的过程被称为RNA-Seq。对于有参考基因组序列的物种,需要根据参考序列进行组装,对于没有参考序列的,需要进行从头组装,利用大量读长之间重叠覆盖和成对读长的相对位置关系,组装得到尽可能完整的转录本,并...
RNA-seq原理详解 1.序列比对及表达定量。 首先是测序得到的fastq文件,通过和参考序列的比对和表达定量,生成原始的定量结果(如下图所示)。最左列是基因名,最上列是不同细胞系/不同处理的名称,中间的数字就是对测序结果的定量值(绝对定量)。 2.数据标准化。