RNA Pull Down 是一种用于研究RNA与蛋白质之间相互作用的实验技术;质谱分析 (Mass Spectrometry, MS) 是一种可用于鉴定和分析复杂生物样品中的蛋白质质量和序列信息的高效、准确的生物分析技术。RNA Pull Down 质谱分析是结合了 RNA Pull Down 和质谱分析的技术,主要用于鉴定特定 RNA 分子与之相互作用的蛋白质。 1...
RNA pulldown质谱技术所需材料包括:1)RNA bait;2)目标蛋白和质控蛋白;3)RNA pulldown probe或其他卫星RNA序列。RNA bait是被用来进行RNApulldown实验的RNA序列,可以根据具体的研究目的选择不同的RNA bait。目标蛋白和质控蛋白是用于证明RNA pulldown蛋白是特定结合而非非特异性结合的蛋白。RNA pulldown probe是用来...
1. RNA pull-down的原理 2. RNA pull-down的应用场景 4. RNA pull-down的操作流程 4.1 样本裂解 4.2 磁珠与RNA结合 4.3 RNA-磁珠复合物与蛋白/RNA结合 4.4 蛋白质洗脱与RNA提取 4.5 质谱分析(可选) 5. RNA pull-down实验所需主要成分和试剂 6. 常见问题及解答 1. RNA pull-down的原理 RNApull-down是...
通过RNA pull-down联合质谱技术检测与长链非编码RNA HSFAS相互结合的蛋白,利用GO和KEGG分析长链非编码RNA HSFAS参与增生性瘢痕进展的主要功能和通路,通过catRAPID和RPISeq网站分析确定长链非编码RNA HSFAS与蛋白的靶向结合。
rna pull down 质谱步骤rna pull down RNA pull down实验是一种用于研究RNA与蛋白质相互作用的技术,其步骤通常包括以下几个阶段: 1.构建RNA过表达质粒:需要通过基因合成并经过测序验证来构建RNA过表达质粒。 2.体外转录模板准备:设计含有T7启动子的引物,通过PCR扩增得到转录模板。 3.体外转录:以PCR产物为模板,...
RNA Pull Down 是一种用于研究RNA与蛋白质之间相互作用的实验技术;质谱分析 (Mass Spectrometry, MS) 是一种可用于鉴定和分析复杂生物样品中的蛋白质质量和序列信息的高效、准确的生物分析技术。RNA Pull Down 质谱分析是结合了 RNA Pull Down 和质谱分析的技术,主要用于鉴定特定 RNA 分子与之相互作用的蛋白质。
分析质谱数据以确定与RNA相互作用的蛋白质种类。对鉴定到的蛋白质进行功能注释和网络分析，以理解RNA-蛋白质相互作用的生物学意义。RNA pull down实验流程 RNA pull down常见问题 1、实验全程需要注意什么？实验使用的所有试剂耗材需经过去RNA酶处理，样本也需要加⼊蛋白酶和RNA酶抑制剂，最好能够进行超声处理。裂解...
rna pull down质谱蛋白选择 RNA pull down质谱是一种常用的方法,用于分析RNA与特定蛋白间的相互作用。在这个实验中,通过将目标RNA分子与其相互作用的蛋白一起沉淀下来,并使用质谱技术进行鉴定和分析。 DNA pull down质谱通常包括以下几个步骤: 1. RNA标记:首先,将目标RNA分子标记上亲和标签,例如生物素、荧光染料等...
RNA pull down:RNA沉淀检测,是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验方法之一。使用体外转录将RNA进行生物素标记,并与细胞蛋白裂解液孵育,形成RNA-蛋白复合物。复合物通过磁珠结合后分离,复合物纯化洗脱后通过Western blot验证检测特性的蛋白。若筛选可能结合的蛋白通过质谱实验进行检测筛选。