RNA pulldown的原理是用生物素标记RNA模拟目的RNA与蛋白直接孵育结合,这就要求探针序列要与目的RNA序列一致,而生物素标记探针只能是线性的,要和circRNA序列尽量保持一致,就要求探针序列要在circRNA全长基础上延长一段circRNA独有的接头序列,来更接近circRNA环状的序列。 RNA pulldown实验是很成熟的,原理也是被公认的,而...
DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)和STRING(http://www.string-db.org/)用于基因聚类分析(GO)注释和功能性蛋白质关联网络分析。 实验结果示例: 图RNA pulldown质谱检测示例图A RNA pulldown蛋白银染示例图。B,C 质谱检测结果GO聚类分析示例图。D,E 质谱检测结果KEGG信号通路分析示例图。F 筛选出蛋白相互作用...
RNA pulldown 的原理是用生物素标记 RNA 模拟目的 RNA 与蛋白直接孵育结合,这就要求探针序列要与目的 RNA 序列一致,而生物素标记探针只能是线性的,要和 circRNA 序列尽量保持一致,就要求探针序列要在 circRNA 全长基础上延长一段circRNA独有的接头序列,来更接近 circRNA 环状的序列。 RNA pulldown 实验是很成熟的...
GST pull down(GST融合蛋白沉降技术)是体外检测蛋白相互作用的常用方法,一般来说,GST融合蛋白pull down方法用于两个方面:一是鉴定能与已知融合蛋白相互作用的未知蛋白质;二是鉴定两个已知蛋白质之间是否存在相互作用。为排除假阳性所设...
Pull down技术可以确定已知的蛋白与钓出蛋白或已纯化的相关蛋白间的相互作用关系,从体外转录或翻译体系中检测出蛋白相互作用关系。RNA pull-down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验手段之一。RNA pull down是使用体外转录法标记生物素RNA探针,然...
可以使用RNA-Pull down技术进行检测。通过生物素特异标记的lncRNA探针与细胞质蛋白提取液进行联合孵育,...
RNA pull-down实验结果分析需要对所捕获的RNA结合伴侣进行进一步鉴定和确认。 一般来说,可以通过以下几种方法进行结果分析: 1. SDS-PAGE和质谱分析 通过聚丙烯酰胺凝胶电泳和质谱分析技术,可以将酸化时迁移起来的复合物(含RNA及其结合伴侣)从琼脂珠中洗出。之后可以利用两种方法将 ...
图4 我司RNA Pull-down案例展示:(A)体外转录法电泳检测图(阳性),左图:PCR扩增DNA的电泳;右图:体外转录标记RNA的电泳;(B)RNA Pull-down的银染结果;(C)MS差异蛋白鉴定及KEGG分析。伯远医学拥有一流的技术团队、丰富的项目经验,提供专业RNA Pull-down技术服务,适用于RNA与蛋白结合的领域研究,欢迎...
RNA pull-down实验结果分析需要对所捕获的RNA结合伴侣进行进一步鉴定和确认。 一般来说,可以通过以下几种方法进行结果分析: 1. SDS-PAGE和质谱分析 通过聚丙烯酰胺凝胶电泳和质谱分析技术,可以将酸化时迁移起来的复合物(含RNA及其结合伴侣)从琼脂珠中洗出。之后可以利用两种方法将 ...
RNA pull down是检测RNA结合蛋白与其靶RNA之间相互作用的主要实验方法之一。使⽤体外转录法标记⽣物素RNA探针,然后与胞浆蛋⽩提取液孵育,形成RNA-蛋⽩质复合物。该复合物可与链霉亲和素标记的磁珠结合,从⽽与孵育液中的其他成分分离。复合物洗脱后,通过WB 实验检测特定的RNA 结合蛋⽩是否与RNA 相互作...