相比于基于 DNA 水平的二代测序(DNA-based NGS)检测,美国国立综合癌症网络(NCCN)公布的 NSCLC 临床实践指南(2023 年第 5 版)已提出基于 RNA 水平的 NGS(RNA-based NGS)检测可能会提高 ROS1、RET、NTRK、MET 14 跳突(MET 14 跳突从 RNA 水平上...
在ALK、ROS1、RET、METexon14、NTRK、FGFR等重要融合基因的检测中,相较于DNA-NGS,RNA-NGS都展现了显著的优势。 21.3% 的 DNA panel 驱动基因阴性肺腺癌患者可通过 RNA panel 检测到有临床意义的融合/重排: 从王博士的报告中,大规模的真实世...
昨天我们已经介绍了NGS文库制备,并解析了使用DNA建库的主要步骤,今天谈一谈如何使用RNA构建NGS文库。 DNA建库的本质是在基因组DNA片段两端加上接头,RNA建库的本质也是如此,RNA建库的策略与DNA建库也基本一致,…
RNA-NGS检测不同融合类型的具有一定的优势,RNA层面检测融合基因中可转录蛋白的外显子,不涉及内含子区域,避免了DNA检测因断点位于内含子区域时,内含子序列长度太长、碱基重复性高,断点位置不集中等问题,减少因探针无法完全覆盖导致的融合基因变异漏检情况,RNA-based NGS使检测融合基因更能反映融合蛋白的产生,结果...
目前ALK融合的检测方法主要有IHC、FISH和NGS,但由于存在ALK融合变异频率较低、肿瘤组织样本难于获取以及检测技术的局限性而面临融合检出的挑战。研究者在1246例NSCLC病例中比较了RNA-based NGS与IHC和FISH检测技术之间的一致性和灵敏度等,发现RNA-based NGS检测周期及结果准确性均较好。表明采取RNA-based NGS检测代替...
RNA-NGS融合检测获NCCN指南推荐2021 V1版非小细胞肺癌NCCN指南指出[3],对于通过panel基因检测未发现驱动基因的患者(尤其是不吸烟者),推荐使用RNA水平的NGS检测来最大化的发现融合基因,避免漏检。同时对于ALK、ROS1、NTRK等融合的检测也推荐使用基于RNA的NGS方法。MET Exon 14跳跃突变是NSCLC重要的治疗靶点,近年...
rnangs通常是指那些在寺院外面设立佛学班的教育环境,如法学课,经典学习等等。rnangs也是指那些主持特殊仪式和活动的僧侣,他们往往是修行时间更长的人,在寺院内外具有广泛影响力,并且在寺院内享有特殊待遇。rnangs是藏传佛教中一个充满神秘色彩的概念,承载着丰富的历史和文化传承。rnangs在藏文化中的...
(PPMS)是一种极为罕见的低级别恶性肉瘤。这种肿瘤常浸润肺组织,并在支气管内生长。它可通过涉及EWSR1基因的基因重排以及独特的染色体易位t(2; 22)(q33; q12)来识别,主要变异类型为EWSR1::CREB1融合。PPMS于2015年首次被WHO分类所认可,当时它属于间叶性肿瘤类别。随后,在2021年的WHO肺部肿瘤分类中,它被归类为肺...
2022年,《非小细胞肺癌MET检测临床专家共识》发布,指出MET 14跳突可用RNA-NGS进行检测。2022年,《中国实体瘤NTRK融合基因临床诊疗专家共识》发布,指出RNA-NGS比DNA-NGS panel具有更 高的灵敏性,RNA-NGS或者转录组可作为NTRK融合基因检测的重要补充手段。2023 年,NSCLC V2版NCCN指南持续指出,应考虑使用RNA-NGS...
基因测序技术NGS是一种革命性的DNA或RNA测序技术,通过建库、测序和数据分析几个步骤能够在相对较短的时间内、同时测序多个DNA或RNA分子,从而实现对基因组、转录组、表观基因组等的全面分析。相比传统的Sanger测序技术,NGS具有更高的通量、更快的速度和更低的成本的优势。