RNA聚合酶II(RNA Pol II)介导的转录是一个高度调控的多步骤过程,负责产生所有mRNA,在不同的步骤中由蛋白质复合物辅助。RNA Pol II在转录起始位点(transcription start site,简称TSS)的招募是通过染色质的打开以及通用转录因子和中介复合...
由于长时间的回溯容易造成有害的碰撞,转录因子IIS(TFIIS)被认为可以迅速恢复转录,它可以促进挤出的“回溯”RNA的切割。这为RNA聚合酶II恢复其正向代码读取扫清了道路。 然而,其他早期的研究表明,当聚合酶回溯超过一定距离(例如,20个核碱基DNA构建块)时,回溯的RNA可以附着在它被挤出的通道上,将其保持在原位的时间更...
研究系统地探索了早期胚胎发育过程中合子基因组激活发生过程中的Pol II参与启动基因转录的模式,揭示了初级ZGA在Pol II “三步走”和主要ZGA(major ZGA)发生中的重要功能和机制,为进一步探究哺乳动物合子基因组激活和早期胚胎发育机理奠定了理论基础。 清华大学生命科学学院颉伟研究组在《自然》上发表题为《RNA聚合酶II...
不论在真核细胞还是细菌中,RNA聚合酶II(RNA Pol II)在转录过程中能够发生回溯(backtracking),这一过程参与基因表达水平的调控和DNA修复。Pol II的回溯导致部分新转录出的RNA 3‘端从Pol II伸出,这一部分能够被转录因子IIS(TFIIS)切割从而恢...
RNA聚合酶II(Pol II)是转录活动的关键元件。但由于胚胎样品数量稀少,无法使用传统ChIP-seq来检测其在染色质上的分布。在该研究中,颉伟课题组与合作者开发了高灵敏度方法来检测蛋白和DNA在全基因组相互作用——Stacc-seq(small-scale Tn5-assisted chromatin cleavage with sequencing),实现了在少量细胞水平上进行Pol ...
RNA聚合酶II(Pol II)是转录活动的关键元件。但由于胚胎样品数量稀少,无法使用传统ChIP-seq来检测其在染色质上的分布。在该研究中,清华大学生命科学学院颉伟课题组与诺唯赞生物(Vazyme Biotech)合作,开发了高灵敏度方法来检测蛋白和DNA在全基因组相互作用——Stacc-seq,实现了在少量细胞水平上进行Pol II的检测,并利...
首先,产生RNA所需的所有分子机器,包括称为RNA聚合酶II的大型蛋白复合物,在给定基因上进行组装。随后,对RNA聚合酶II的特定化学修饰允许它开始将DNA转录成RNA。这种从所谓的转录起始转变为活跃转录的过程还涉及另一个重要的分子转变:随着RNA分子开始延长,剪接复合物(splicingapparatus)也必须介入其中并完成它的工作。
DNA损伤,如紫外线照射导致的大面积损伤,会引起DNA修复,RNA聚合酶II(RNAPII)降解以及全基因组转录关闭等过程【1】。核苷酸切除修复(NER)是DNA修复的主要途径,其可分为转录耦连的核苷酸切除修复(transcription-coupled nucleotide excision repair,TC-NER)和全基因组核苷酸切除修复(Global-Genome Nucleotide excision repair...
虽然大多数circRNAs从染色质释放后功能未知,少数circRNA则在他们的转录位置积累并与RNA聚合酶II(Pol II)结合,成为转录的正调控因子,但是这个新的调节模式的具体细节还很模糊。目前已经被人熟知共转录剪接模式的特点,这种机制确保了剪接时对于mRNA前体上剪接位点的顺序性识别,并且还允许各种剪接增强和抑制因子及时竞争以...
RNA聚合酶II核心启动子——转录的途径 概要 RNA聚合酶II(负责真核生物蛋白编码基因的转录(产物mRNA),有7-10个亚基,最大亚基的羧基末端结构域(CTD)具有7个氨基酸(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser -Pro-Set)的重复序列,其中有多个磷酸化位点.CTD磷酸化对调控基因转录有重要作用.)核心启动子(真核生物启动子中转录起始...