04多组学联合分析和案例分享 在研究中大多数技术都不是单一使用,RIP-seq也不例外,它会搭配其他组学一起对研究的深度和广度进行扩充。RIP-seq可以与多种技术联合分析,例如RNA-seq、 RNA pull down、m6A-seq等。本次精选几篇联合分析的文章,帮助大家开拓思路。 案例分享一 题目:RIP-Seq of EZH2 Identifies TCONS-...
RNA结合蛋白研究领域的RIP-seq实验,是一种通过抗体捕获细胞内RNA与蛋白复合物的高通量测序技术。它在理解转录后调控网络动态中扮演着关键角色,主要应用于研究RNA与蛋白的相互作用,包括非编码RNA如LncRNA、miRNA等。以下是RIP-seq实验的基本分析流程和两个案例分享。实验流程包括前期准备,如提供基因组信息...
Small RNA文库实验步骤 03分析流程 分析结果主要包括基因组比对分析、Reads在基因功能元件上分布、PCA分析、基因组Peak分析、Peak关联基因的GO/KEGG分析、富集区间Motif分析等。(感兴趣的老师可以联系爱基百客相关人员获取结题报告demo) 04多组学联合分析和案例分享 在研究中大多数技术都不是单一使用,RIP-seq也不例外,...
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RNA免疫共沉淀—RIP-seq(RNA Immunoprecipititation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,RIP利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物(RBP)沉淀下来,分离纯化捕获的RNA,结合高通量测序技术对目标RNA进行测序分析。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术