楼主好，我在那个网站下到的vmd.rc和.vmdrc感觉是一样的。我改成window版的文件用\，而不是/ 但是...
Root mean square deviation (RMSD), RMS fluctuation (RMSF), Radius of Gyration (Rg), Dynamic secondary structure prediction (DSSP), SASA of AL, the H-bond and salt bridging distances were calculated using CPPTRAJ module [41]. The trajectories were analyzed at every 1ps and visualized in ...
+6 分享59 药物研发吧 ༺峰༻ 计算机辅助药物设计技术与应用实践11构象分析11.1RMSD分析11.2B-Factory 分析11.3RMSF分析11.4RG分析11.5VMD动画展示11.6距离角度测量11.7溶剂可及表面积(SASA)主要知识点 12能量分析12.1残基分解(相互作用分析)12.2丙氨酸扫描(寻找热点残基)12.3氢键网络(盐桥,pi-pi共轭等其它... 分享...
http://www.meduniwien.ac.at/msi/biosim/bk/a1375/ 里面还有个manual,介绍了如果在WIN下和LINUX下安装可自动计算RMSD,RMSF和SASA,具有图形化界面希望对大家有用。 PS:在WIN下成功安装了,但是在UBUNTU下无法正常安装 能安装的朋友麻烦给指点一下,作者说OPENSUSE可以 一个介绍该plugin 的paper http://onlinelibr...