设备设置下载并安装rMATS-turbo可以通过conda使用以下命令安装rMATS-turbo和所有必需的依赖项:conda install -c conda-forge -c bioconda rmats▲ 重要:为了避免软件包冲突,应在专用的conda环境中执行此操作。或者,在安装了所需的依赖项之后,可以通过GitHub存储库下载并安装rMATS-turbo:git clonehttps://github.com/...
接着让我们看看rMATS v4.0.2 (turbo)的用法 它只有一个步骤,直接根据分组对bam文件进行可变剪切的差异分析,通过统计模型对不同样本(有生物学重复的)进行可变剪切事件的表达定量,然后以likelihood-ratio test计算P value来表示两组样品在IncLevel(Inclusion Level)水平上的差异(从公式上来看,IncLevel跟PSI的定义也是类...
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