由于rmats中只会计算可变剪切事件的inclusion level值,并没有提供95%执行区间的值,所以没有右侧的柱状图。图中的IncLevel值是直接从rmats的输出结果中读取的,所以二者是一致的。 对于曲线上方标记的reads数目,和rmats输出结果中的IJC和SJC是不同的,因为是两个软件统计的结果,从配置文件可以看出,只提供了bam文件给mi...
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这种可视化形式能够直观的展示可变剪切分析的结果,所以其他的可变剪切软件也争相效仿,rmats也提供了类似的功能,将rmats的输出结果用这种方式展示,对应的软件链接如下 https://github.com/Xinglab/rmats2sashimiplot 用法如下 rmats2sashimiplot \ --b1 control.bam \ --b2 case.bam \ --l1 control...
这种可视化形式能够直观的展示可变剪切分析的结果,所以其他的可变剪切软件也争相效仿,rmats也提供了类似的功能,将rmats的输出结果用这种方式展示,对应的软件链接如下 https://github.com/Xinglab/rmats2sashimiplot 用法如下 rmats2sashimiplot --b1 control.bam --b2 case.bam --l1 control --l2 case --exon_s...
这种可视化形式能够直观的展示可变剪切分析的结果,所以其他的可变剪切软件也争相效仿,rmats也提供了类似的功能,将rmats的输出结果用这种方式展示,对应的软件链接如下 https://github.com/Xinglab/rmats2sashimiplot 用法如下 rmats2sashimiplot --b1 control.bam --b2 case.bam --l1 control --l2 case --exon_s...