RNA免疫共沉淀—RIP-seq(RNA Immunoprecipititation)是研究细胞内RNA与蛋白结合情况的技术,RIP利用目标蛋白的抗体将相应的RNA-蛋白复合物(RBP)沉淀下来,分离纯化捕获的RNA,结合高通量测序技术对目标RNA进行测序分析。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,蛋白结合对象为RNA,RIP-seq即对富集得到的...
RIP-seq是将RNA免疫共沉淀(RNA Immunoprecipitation,RIP)与二代测序技术(NGS)相结合以研究细胞内RNA与蛋白互作的技术,RIP利用目标蛋白抗体把相应的RNA-蛋白复合物(RNA Binding Protein,RBP)沉淀下来,然后经过富集和纯化就可以对结合在复合物上的RNA进行测序分析。 RIP-seq对富集得到的RNA片段通过高通量测序,在全转录组...
RIP-Seq互作组验证,即在互作组分析筛选的基础上,进一步利用RIP-qPCR技术对感兴趣分子进行靶向检测,更加精细,也是互作组验证的必由之路。成功验证上岸的基础是理想的互作组数据库和丰富的分析经验,方能事半功倍。广州基云生物,在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域,具有丰富的经验,助力您的互作机制研究。
RIP-Seq是一种用于研究RNA与蛋白质相互作用的技术,其基本流程如下: 1.准备样本:可以从各种来源获取样本,如细胞、组织、蛋白质复合物等。 2.免疫沉淀:使用针对特定RNA或蛋白质的抗体进行免疫沉淀,以捕获RNA-蛋白质复合物。 3.测序文库制备:将捕获的RNA-蛋白质复合物进行破碎,释放出RNA和蛋白质,并对RNA和蛋白质进...
RIP-seq,全称 RNA Immunoprecipitation Sequencing,该技术从一种已知的蛋白质出发,使用针对该蛋白的特异性抗体将目标蛋白以及与其结合的 RNA 复合物沉淀下来, 进而对富集到的 RNA 进行分离和建库测序,从而揭示 蛋白质-RNA 之间的结合关系。 RIP-seq 拥有广泛的应用场景,例如:通过针对 AGO2 蛋白的 RIP-seq,可以获取...
接下来,研究人员通过RNA测序(RNA-seq)和RNA免疫沉淀测序(RIP-seq)鉴定了USP39调控的可变剪接事件。转录组学分析显示,USP39缺失诱导了可变剪接模式的全局变化,其特征是跳过外显子以及内含子和基因间区域比例过高。此外,RIP-seq显示USP39优先结合5’和3’剪接位点附近的外显子-内含子区域。特别是,USP39促进了HMGA2...
RIP-Seq是一种研究细胞内蛋白与RNA相互作用的高通量技术。它结合了免疫共沉淀与RNA测序,用于系统性检测和分析特定细胞或组织中目的蛋白的RNA互作组。该技术不仅适用于目的蛋白的RNA互作组数据检测,还适用于不同遗传背景或实验条件下的互作组差异研究。因此,RIP-Seq是探究细胞内蛋白与RNA调控网络的重要...
RIP-seq讲解 康测科技 1948 0 CUT&Tag测序技术全方位介绍 康测科技 50 0 绝对定量转录组测序 UMI RNA-seq保姆级介绍 康测科技 51 0 m6A meRIP结题解读报告 康测科技 155 0 miRNA-seq结题报告解读 康测科技 40 0 LACE-seq结题报告解读 康测科技 1 0 ...
RIP-seq巧妙地将RNA免疫沉淀(RIP)与二代测序(NGS)结合,旨在探究细胞内RNA与蛋白间的相互作用。它通过特定抗体捕获RNA-蛋白复合物,随后通过富集和纯化,对复合物上的RNA进行测序分析,揭示RNA分子与RBP的交互,包括非编码RNA的参与。该技术在全转录组范围内分析RNA与蛋白的结合情况,是研究转录后调控网络...