简介 通过染色质免疫沉淀(ChIP)检测和测序技术相结合,ChIP测序(ChIP-Seq)成为鉴定转录因子及其他蛋白因子在全基因组范围内的DNA结合位点的强有力方法。在ChIP操作之后,通过特异抗体将DNA结合蛋白免疫沉淀。…
轻松学会ChIP-seq:RIP-seq, 视频播放量 2560、弹幕量 0、点赞数 47、投硬币枚数 20、收藏人数 171、转发人数 21, 视频作者 吉凯基因, 作者简介 吉凯基因B站唯一官方号,您的科研小助手,相关视频:RNA-seq报告解读,meRIP-seq报告解读,全基因组测序WGS报告解读,circRNA-se
转录因子找靶标-ChIPseq结合过表达敲低RNAseq-上-分析思路 235 -- 1:31 App 如果每个分类的细胞亚型都能做个生存预后分析,看看是否显著,这样就知道,这个细胞价值大不大了 598 -- 10:04 App 多组学数据挖掘3-多组学研究有哪些组学数据可用? 736 1 8:27 App circRNA翻译研究挑选证明找机制方法总结 531 -...
目前有很多RIP-seq的分析流程是参照ChIP-seq的分析流程进行,包括用来寻找peak(显著富集区域)的软件。但RIP-seq与ChIP-seq存在很多差异: 1,RNA是单链,ChIP-seq所用的双峰查找模式不适用,并且存在链特异性问题; 2,RNA存在选择性剪接事件,需要用剪接比对工具将reads比对基因组; 3,RIP-seq目的是寻找与特定蛋白结合的...
小伙伴都知道小编家的明星产品ChIP-seq,通过免疫共沉淀获得蛋白互作的DNA;同样的蛋白和RNA有着千丝万缕的互作关系,获得蛋白结合的RNA就需要我们的RIP-seq & CLIP-seq展现魅力了。 简单来说是通过抗体与靶蛋白进行免疫沉淀反应,将共沉淀下来的RNA分子进行高通量测序。高通量测序作为“科研神队友”,结合传统的免疫沉淀...
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RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀CHIP技术的类似应用, 蛋白结合对象是RNA,RIP-seq即对富集得到的RNA片段进行高通量测序,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具,能够有效探究在基因范围内发现与蛋白或蛋白复合物相结合的RNA。 说完RIP-SEQ的技术原理,相信各位小伙伴对它也有了大概的了解,那在实际情况中我们该...
RIP-Seq是一种检测细胞内蛋白/RNA互作组的高通量技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和RNA测序技术对目的...
通常,ChIP 用来检测某种特异蛋白或某种特异蛋白修饰在某个基因组区域的相对丰度。并依赖于使用一种抗体从细胞或组织提取物蛋白混合物中分离某种蛋白、组蛋白、转录因子或辅因子及其结合的染色质,或使之沉淀。因此,这种技术的名称为:染色质免疫沉淀法。在 ChIP-PCR 或 ChIP-seq 中,使用广泛提供的 PCR 或 qPCR 试剂...
ChIP-seq实验的基本流程包括四个步骤:(1)获取原始样本;(2)免疫沉淀,通过免疫技术将特定蛋白与DNA结合;(3)限制性内切酶切割,利用限制性内切酶将结合DNA分解成若干片段;(4)高通量测序,通过测序产生的序列数据,研究特定蛋白质与DNA的相互作用。 ChIP-seq实验能够精准定位特定蛋白与基因组DNA的结合位点,可以用来研究转录...