1.首先在SNP-Seek(snp-seek.irri.org/)中,进入Genotypes, 2.在Gen locus,输入基因ID(注意是LOC_类型的),并且可以在START和End中自行选择所要分析基因位置,然后在Show phenotype中选择是要分析的表型,完成后点击SEARCH. 3.分析好后,点击CSV,将结果下载下来。(切记在CSV文件中不要做任何处理,改文件格式无法保存...
SNP和等位基因信息被组织成一个SNP-Seek系统(http://www.oryzasnp.org/iric-portal/),该系统由Oracle数据库组成,该数据库具有SNP基因型接近600亿的行总数(20 M个SNP x 3 K水稻行)和Web界面,方便查询。该数据库允许快速检索给定基因组区域中所有变种的SNP等位基因,从预定的变种中查找不同的等位基因,并查询有...