Ribo-seq(核糖体印记测序),作为一种翻译组测序技术,已被广泛应用于研究细胞内mRNA的翻译动态。通过测序与核糖体结合的mRNA片段(RPFs),该技术能够揭示在特定条件下哪些mRNA正在被翻译,以及它们的翻译效率和起始位点等关键信息。Ribo-seq的应用极大地促进了对基因表达转录后调控、疾病机制和药物作用机理的理解。 二、Ribo...
Ribo-seq(核糖体印记测序),作为一种翻译组测序技术,已被广泛应用于研究细胞内mRNA的翻译动态。通过测序与核糖体结合的mRNA片段(RPFs),该技术能够揭示在特定条件下哪些mRNA正在被翻译,以及它们的翻译效率和起始位点等关键信息。Ribo-seq的应用极大地促进了对基因表达转录后调控、疾病机制和药物作用机理的理解。 二、Ribo...
翻译组测序是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,来准确获取样本中所有可翻译分子(包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA、circRNA等)的信息与精确定量。 Ribo-seq (Ribosome profiling sequencing)是最常用的一种翻译组测序技术,该技术利用RNA酶消化细胞中的RNA,得到被核糖体保护的正在翻译的RNA片段(ribos...
通过Ribo-seq可获得全基因组水平的蛋白翻译情况,发现新蛋白/短肽。同时,还可以和转录组数据联合计算RNA的翻译效率,或与蛋白组的数据联合分析瞬时翻译与蛋白累积的关系,分析蛋白的降解效应等。 由于Ribo-seq主要分析编码序列(CDS),即核糖体结合mRNA的区域,而对于与翻译调控高度相关的非翻译区(UTRs)不能有效分析。但R...
翻译组测序(Ribo-seq)是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,来准确获取样本中所有可翻译分子(包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA, circRNA等)的信息与精确定量,是连接转录组与蛋白质组之间的桥梁。 Ribo-seq是最常用的一种翻译组测序技术,该技术利用RNA酶消化细胞中的RNA,得到被核糖体保护的正在翻...
翻译组测序是指对与核糖体结合的正在翻译的RNA片段进行测序,来准确获取样本中所有可翻译分子(包括mRNA和其他潜在可翻译RNA分子如lncRNA, circRNA等)的信息与精确定量,是连接转录组与蛋白质组之间的桥梁。Ribo-seq (Ribosome profiling sequencing)是最常用的一种翻译组测序技术,该技术利用RNA酶消化细胞中的RNA,得到被...
Ribo-seq可以研究细胞内基因翻译的区域、水平、速率等,与转录组、蛋白质组以及ncRNA测序等进行关联分析,可以揭示转录后调控网络以及识别新的蛋白质编码基因。 1.Ribo-seq技术原理 该技术利用蛋白酶抑制剂瞬时捕获住处于翻译过程的多聚核糖体与RNA链复合物,再通过RNA酶消化细胞中的RNA,得到被核糖体保护的正在翻译的...
翻译组学测序技术: (1)Ribo-seq(Ribosome profiling sequencing)核糖体印迹分析 Ribo-seq是最常用的一种翻译组测序技术,首次由Ingolia等人在2009年发表。该技术通过利用RNA酶消化细胞中的RNA,以降解除受核糖体保护的RNA片段外的所有mRNA,得到被核糖体保护的正在翻译的RNA片段(ribosome footprints,RFPs),然后对这些被...
我们为研究者提供简便快速的核糖体印迹分析技术和服务,通过更高的分辨率观察全局的翻译情况,挖掘潜在的微肽,识别肿瘤相关抗原,指导mRNA治疗。QEZ-seq® 技术源自美国康奈尔大学,由美国EzraBio Inc. 和中国新使生物科技有限公司合作开发。该项技术以前所未有的速度和
Ribo-seq研究思路 1.表达量分析 我们时常会发现蛋白质丰度和RNA表达量的相关性并不理想,这时候,我们可以通过研究基因的翻译表达量从而解释这一现象。除此之外,当在转录水平发现过多或过少的差异基因,我们可以通过将翻译组和转录组的数据进行联合分析,优化目标基因的筛选范围;也可以通过与转录组进行共表达分析,找到符...