從今天起,我把R中遇到的每個報錯都記錄下來,一個是爲了做記錄以後可以用,另外一個也是分享給跟我一樣的小菜鳥。 今天的一個報錯:R包hdf5r安装失败 解決方法: 在終端輸入:sudo apt-get install libhdf5-dev …
这表明加载包的时候不能识别 hdf5 的动态库,实际包已经安装好了,只是不能加载 hdf5 动态库,需要手动配置 hdf5 动态库 libhdf5_hl.so.100,方法参考 这和 这,也就是通过在 ~/.Rprofile 中添加 #echo “dyn.load(’/usr/local/hdf5/lib/libhdf5_hl.so.100’)” >> ~/.Rprofile dyn.load(’/usr/loca...
ERROR: configuration failed for package ‘hdf5r’解决办法:1. 下载hdf5-1.8.13的源码wget https://support.hdfgroup.org/ftp/HDF5/releases/hdf5-1.8/hdf5-1.8.13/src/hdf5-1.8.13.tar.bz2 2. 编译安装tar xjf hdf5-1.8.13.tar.bz2 cd hdf5-1.8.13 ./configure --prefix=$HOME/.local/bin/hdf5-1.8...
macports-packages-R-rhdf5安装包是阿里云官方提供的开源镜像免费下载服务,每天下载量过亿,阿里巴巴开源镜像站为包含macports-packages-R-rhdf5安装包的几百个操作系统镜像和依赖包镜像进行免费CDN加速,更新频率高、稳定安全。
解压缩后,./configure--prefix=/usr/local/hdf5,make,make install 在R中, install.packages("hdf5r",configure.args="--with-hdf5=/usr/local/hdf5/bin/h5cc") 参考: 简书-centos-hdf5r安装 CSDN-centos7系统中安装 HDF5R 包
R包hdf5r安装报错 在安装loomR的时候,必须要先安装hdf5r # Install devtools from CRANinstall.packages("devtools")# Use devtools to install hdf5r and loomR from GitHubdevtools::install_github(repo="hhoeflin/hdf5r")devtools::install_github(repo="mojaveazure/loomR",ref="develop")...
安装R包(“clonotypeR“) clonotypeR 包,可整合免疫组库(VDJ)与scRNA-seq; 主要函数包括AddClonotypes()和LoadClonotypes()。安装代码如下:...r语言安装r包 r语言安装r包2020 首先根据r包存储的地方,就可以分为三种下载方式 CRAN bioconductor GitHub 其他安装方式 首先根据r包存储的地方,就可以分为三种下载...
./configure --prefix=$HOME/.local/bin/hdf5-1.8.13 make && make install 3. 设置环境变量 export PATH=$HOME/.local/bin/hdf5-1.8.13/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$HOME/.local/bin/hdf5-1.8.13/lib:$LD_LIBRARY_PATH 4. 重新安装R包hdf5r ...
Rstudio 安装 HDF5r 包 1. sudo apt-get install libhdf5-dev 2. install.packages("hdf5r", configure.args="--with-hdf5=/usr/bin/h5cc")