名词解释:rep-PCR 即重复序列聚合酶链式反应(Repetitive Sequence - Polymerase Chain Reaction)。它是一种基于细菌基因组中广泛存在的重复序列来进行细菌分型和鉴定的分子生物学技术。通过扩增这些重复序列之间的可变区,产生具有菌株特异性的 DNA 指纹图谱,从而区分不同的细菌菌株。 英语释义:A molecular biology techniq...
Rep-PCR：Versalovic于1996年描述的一种细菌基因组指纹分析方法，即细菌基因组重复序列PCR技术（rep-PCR）是扩增细菌基因组中广泛分布的短重复序列，通过电泳条带比较分析，揭示基因组间的差异。细菌基因组中广泛分布的短重复序列（repetitive sequence），包括常用的REP（repetitive Extragenic Palindromic,基因...
原核生物基因组中的重复序列主要分为两种：基因外重复回文元件（REP元件）和细菌内基因重复一致序列（EMC序列）。利用与保守重复序列高度匹配的寡核苷酸作为引物，扩增重复序列之间的DNA片段，可以产生具有物种或菌株特异性的条带，这就是rep-PCR。rep-PCR的反应条件相对严格，具有良好的重复性和易操作性，...
产生的REP(REP.repetitiveextragenicpalin.1.0kb和2.1kb4条带组成,第5条片段为dromie).PCR指纹,并测定这种方法的分辨2.0bp.将循环数增加到39或40次,大多数 能力;(2)确定能否用一个扩增的PEP片段HS分离物可产生一条3.5kb的带.经 鉴别菌株;(3)确定REP图形与以前报告的PCR34次循环后在大多数北美HS图形中可...
摘要: 对大肠杆菌,枯草杆菌,四联球 菌,普通变形杆菌,产气肠杆菌基因组DNA进行rep-PCR扩增,并在模板样品中混入植物DNA作对照实验.结果表明:用rep-PCR方法分析细菌基 因多样性,能在较大范围内避免植物基因的干扰.模板量梯度实验结果显示:扩增产物多态性与模板量相关.关键词:...
REP-PCR是一种高度敏感、快速、易操作的基因分型技术,其主要原理为使用特定的引物扩增细菌染色体上的REP序列,产生高度多态性的DNA片段。这些片段的大小和数量不仅能够反映细菌菌株间的遗传差异,还可以用于快速鉴定与分类等方面。 随后,阐述了REP-PCR技术在布鲁氏菌流行病学研究中的应用。通过对不同地区、不同时间、不...
Rep-PCR技术的原理是利用特定的引物扩增细菌基因组DNA的重复序列,这些序列在进化过程中高度保守,扩增位于这些序列之间的不同区域可得到不同的图谱,扩增产物经凝胶电泳便可以分析其多态性。 Rep-PCR通常有5种方法用于不同细菌的基因分型。这 5种方法分别为 Rep-PCR,ERIC-PCR,ERIC2-PCR,BOX-PCR,其设计引物长度一般...
目的:采用细菌基因外重复回文序列扩增(REP-PCR)和肠道细菌基因间重复序列扩增(ERIC-PCR)两种方法对副溶血性弧菌2株标准株,13株实验室保存菌株和73株分离菌株共88株进行分子分型。方法:通过REP和ERICPCR指纹图谱扩增,利用NTsys-pc软件采用Dice系数对指纹图谱进行聚类结果分析。结果:所有供试菌株可通过此两种方法进行分...
目的 运用Agilent生物分析仪对临床白假丝酵母菌进行重复序列(REP)-聚合酶链反应(PCR)分型,并分析其流行趋势.方法 设计REP引物,进行PCR扩增,用DL7500 Labchip芯片在Agilent 2100 生物分析仪上对产物做微流电泳,获得虚拟凝胶视图,再运用GelCompareⅡ软件对其DNA指纹图谱做聚类分析.结果 白假丝酵母菌菌株指纹图谱相似度...
REP-PCR分型法用于白假丝酵母菌群分析