mysql --user=genome --host=genome-mysql.cse.ucsc.edu -A -N -e "select * from refGene" hg19 ' cut -f2- ' genePredToGtf -source=hg19.refGene.ucsc file stdin stdout > refSeq.hg19.gtf genePredToGtf可以从UCSC下载,需要注意的直接下载refFlat的文件(不通过mysql),用genePhredToGtf生成的文件和U...