RefSeq是NCBI提供的参考序列数据库,提供注释完整、非冗余、可作为参考标准的序列数据,涵盖基因组、转录本和蛋白质,常用于基因组学研究
RefSeq(RNA reference sequences collection,)是NCBI维护的标准参考序列数据库,提供了具有生物意义上的非冗余的基因、转录本及蛋白质序列,详细介绍可以参考RefSeq官网(ncbi.nlm.nih.gov/refseq) UCSC Genome Browser 将这一权威数据库作为一个track,方便研究人员进行基因特征的分析。 RefSeq 配置信息 display mode 信息的...
⑥Refseq RNA(refseq_rna):包含了NCBI Refseq 数据库中编码蛋白质的mRNA和非编码RNA,包括NCBI Refseq 数据库中的NM_,NR_,XM_,XR_序列。适用于序列类型为mRNA、lncRNA等的情况; ⑦Custom:使用自己的序列,包括核苷酸序列、基因组组装加入(如GCF_000001635.27)或FASTA序列作为搜索数据库。最多允许加入20个组件,且FAS...
RefSeq数据库存储了公开可用的核酸序列(DNA、RNA)及其蛋白产物数据,包含基因组、 转录本和蛋白质的参考序列。 RefSeq命名采用2个英文字母+下划线_+数字gi规则。 2.1 第一字母含义 X或Y:表示RefSeq通过对全基因组序列计算预测生成,没有实验证据的,产生的序列为“model RefSeq”; N:表示经实验验证的序列,产生的序列...
基因组组装和注释质量通过完整核糖体 RNA 和基本保守蛋白质的存在进一步测量。提交为“完整”的基因组中缺失或不完整的基因表明存在测序或组装错误。存在此类错误的参考基因组不被纳入refseq数据库。 3.4 行业机构提交基因组和基因的政策 关于...
RefSeq数据库中所有的数据是一个非冗余的、提供参考标准的数据,包括染色体、基因组(细胞器、病毒、质粒)、蛋白、RNA等。RefSeq数据库被设计成每个人类位点挑出一个代表序列来减少重复,是NCBI提供的校正的序列数据和相关的信息。数据库包括构建的基因组contig、mRNA、蛋白和整个染色体。refseq序列是NCBI筛选过的非冗余数据...
NCBI RefSeq(美国国立生物技术信息中心参考序列库)是目前世界上最具有权威性的序列数据库,该数据库中所有的数据是一个非冗余的、提供参考标准的数据,包括染色体、基因组(细胞器、病毒、质粒)、蛋白、RNA等。 我们在NCBI RefSeq 上找序列时,经常会看到各种标记的序列,但是不知道哪个才是想要的。
NCBI的参考序列(RefSeq)计划,为多种生物提供序列的数据信息及相关资料,用于医学、基因功能和基因功能比较研究。RefSeq数据库中所有的数据是一个非冗余的、提供参考标准的数据,包括染色体、基因组(细胞器、病毒、质粒)、蛋白、RNA等。 RefSeq和genbank的数据有什么区别?
RefSeq数据库中所有的数据是一个非冗余的、提供参考标准的数据,包括染色体、基因组(细胞器、病毒、质粒)、蛋白、RNA等。 其标志是开头两字母+下划线。
基因组DNA,RNA,蛋白产物 是医学、功能、多样性研究的一个基准 为基因组注释,基因鉴定和特性描述,突变和多态性分析,表达研究和比较分析提供稳定可靠的参考 由NCBI和其合作者维护 由于一些序列来自异常连接产生的转录物或由计算机推演产生的不正确内含子-外显子剪切,因此该数据库所收集的参考序列一直在不断地被修改中...