Phi-psi plot,也被称为Ramachandran plot(拉马昌德兰图),是一种用于展示蛋白质中氨基酸残基的ϕ(phi)和ψ(psi)二面角的分布图。这种图是由印度科学家G.N. Ramachandran在1963年首次引入的,主要用于研究蛋白质结构的特性。 作用和重要性 1 蛋白质结构验证: 结构可行性:Ramachandran plot能显示出哪些ϕ和ψ角是...
拉氏图(又名 Ramachandran 图,[φ,ψ]图, α-碳与酰胺平面交角图,英名 Ramachandran plot, Ramachandran diagram, 或 [φ,ψ] plot),起初是于1963年被 G. N. Ramachandran,C. Ramakrishnan 和 V. Sasisekharan 提出的,是一种使蛋白质结构中,主链氨基酸残基的二面角 ψ和φ 可视化的方法。 Ramachandran Plot...
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1. 准备数据 打开DS软件,对于一个蛋白质,这里使用三个不同的构象作为例子。 2. 将蛋白质文件拖到DS中一定要把所有的蛋白质拖到同一个窗口中,不然不会显示在一起。 Chart ---RamachandranPlot可以画蛋白质拉式图,横坐标为phi,纵坐标为psi,分别对应与氨基酸单元的两个二面角(C-N-Cα-C)和(N-Cα-C-N)...
Ramachandran plot(拉氏图)是由G. N. Ramachandran等人[1]于1963年开发的,用来描述蛋白质结构中氨基酸残基二面角ψ和φ是否在合理区域的一种可视化方法。同时也可以反映出该蛋白质的构象是否合理。 在介绍Ramachandran plot前有必要简单说明一下二面角。 图一 ...
拉氏构象图(Ramachandran plot) 相关知识点: 试题来源: 解析 Ramachaildran以非键合原子之间的接触距离为依据,用蛋白质二面角Ф作横坐标,ψ作纵坐标,作图推测哪些成对二面角所规定的两个相邻肽平面的构象是立体化学所允许的,哪些是不允许的。这个Ф-ψ图,就叫:Ramachandran构象图。 依据,用蛋白质二面角Ф作横坐标,...
此外,Ramachandran plot可辨识蛋白质链中不同结构元素,如α-螺旋、β-折叠和左手α-螺旋等,每种结构有特定(ϕ,ψ)角范围。作为直观教育和研究工具,它在生物化学和分子生物学教学中十分有用,帮助理解蛋白质构象自由度和结构多样性。它也是研究蛋白质折叠、动力学及演化的有力工具,用于蛋白...
拉氏图(Ramachandran图)是1963年由G. N. Ramachandran, C. Ramakrishnan和V. Sasisekharan提出的,用于可视化蛋白质主链氨基酸残基的二面角φ和ψ的工具。拉氏图表示的是α碳的两面角,φ表示一个肽单位中α碳左边C-N键的旋转角度,ψ表示α碳右边C-C键的旋转角度。理论上,由于分子各个基团的空间...
ramachandran plot 英汉医学词典 n.拉马钱德兰图拉氏图 专业医学词典 拉马钱德兰图,拉(氏)图(α-碳与酰胺平面交角图) 与"ramachandran plot"相近的词条 ... Ram epididymitis bacterin ram pressure ram pump ram testes ramachandran map Ramachandran ramachandran plot Ramadan Ramadier operation Ramadier手术 ramal ...
Ramachandran plot(拉氏图)是由G. N. Ramachandran等人[1]于1963年开发的,用来描述蛋白质结构中氨基酸残基二面角ψ和φ是否在合理区域的一种可视化方法。同时也可以反映出该蛋白质的构象是否合理。 在介绍Ramachandran plot前有必要简单说明一下二面角。 图1 蛋白质链上肽平面之间形成的二面角以及 两个残基脱水缩合后...