A:一般情况下,群体进化研究涉及较大的样本量,RAD-seq可大幅降低基因组的复杂度,降低建库和测序成本,操作简便。另外,它不受参考基因组的限制,研究物种范围更广泛。RAD-Seq尤其适合于大样本量的研究,可以为利用全基因组重测序技术做深度信息挖掘奠定坚实的基础。
以下步骤应用RADseq 技术: 1、样品收集:收集不同物种的DNA 样品,并确保这些样品代表了该 物种的遗传多样性。 2、限制性酶切:用限制性酶切割DNA 样品,产生RAD tag。 3、标签连接:将RAD tag 与 adapter 连接,以便进行测序。 4、二代测序:对连接后的DNA 进行测序,得到原始测序数据。
通过一次测序就可以获得数以万计的多态性标记.目前,RAD-seq技术已成功应用于超高密度遗传图谱的构建,重要性状的精细定位,辅助基因组序列组装,群体基因组学以及系统发生学等基因组研究热点领域.文章主要介绍了RAD-seq的技术原理,技术发展及其在基因组研究中的广泛应用.鉴于RAD-seq方法的独特性,该技术必将在复杂基因组...
与此同时,也不断有新的技术优化引入到简化基因组的开发中。 2016 年初,晶能生物联合复旦大学,成功开发出全新的简化基因组 RAD-seq 技术平台。这种优化的实验技术平台,可以实现目标性的基因组简化程度、预判可检测的多态性位点数目、完成检测目标区域在基因组分布的密度和均一度评估分析。同时,她的最大优势在于,实验...
目前, RAD-seq 技术已成功应用于超高密度遗传图谱的构建、重要性状的精细定位、辅助基因组序列组装、群体基因组学以及系统发生学等基因组研究热点领域。文章主要介绍了RAD-seq 的技术原理、技术发展及其在基因组研究中的广泛应用。鉴于RAD-seq 方法的独特性, 该技术必将在复杂基因组研究领域具有广泛的应用前景。关键词...
为了验证上述假说,本研究采用基于第二代测序平台的简化基因组ddRAD-seq技术,针对四个物种(包含C.hainanus、C.rubeculoides、C.glaucicomans 以及 C.unicolor 作为外群)6 个亚种/种群的45个个体,开展全基因组水平21,283个单核苷酸多态性(SNPs)位点的深入分析。根据系统发生和群体基因组分析的结果显示,C.r.kloss...
RAD_seq技术在基因组研究中的现状及展望_王洋坤