2024年2月29日Funct Plant Biol在线发表Genome-wide identification, phylogeny and expression analysis of the R2R3-MYB gene family in quinoa (Chenopodium quinoa) under abiotic stress,系统鉴定藜麦 R2R3-MYB基因家族。 基因家族分析SCI服务 摘要 MYB转录因子(TF)是植物中最大的基因家族之一,负责多种生物过程。...
水稻R2R3型MYB转录因子是一类具有特定DNA结合域的蛋白质,它们能够与特定的DNA序列结合,从而调控基因的表达。这些蛋白质的结构特点是含有两个MYB结构域,分别称为R2和R3结构域。这两个结构域通过一个可变的间隔区域相连,形成了一个完整的MYB结构域。水稻R2R3型MYB转录因子的基因家族较为庞大,目前已经鉴定出了超过100个...
1.序列比对 与已知MYB蛋白序列比对：将待测蛋白序列与已知具有R2和R3结构域的MYB蛋白序列进行比对。如果...
MYB 数量最多,功能最广泛,有研究表明黄花蒿 R2R3-MYB 转录因子能调控分泌性腺毛的发育及青蒿素的生物合成,但相关研究还较少.以黄花蒿基因组数据为基础,通过本 地 BLAST 和 HMMsearch 的方法,获得黄花蒿 R2R3-MYB 转录因子序列 132 条,并对其保守结构域进行分析,同时构建了与拟南 芥 R2R3-MYB 转录因子的系统...
近日,Horticultural Plant Journal在线发表了南京农业大学吴俊教授团队题为“PbrMYB4, a R2R3-MYB protein, regulates pear stone cell lignification through activation of lignin biosynthesis genes(R2R3-MYB转录因子PbrMYB4通过激活木质素...
BLAST 分析表明 RLM1 编码了一个 R2R3 MYB 转录因子。蛋白质基序分析表明 RLM1 包含一个 N 端结构域 (R2R3) 和一个 C 端结构域 (CTD)。N端可能主要与其他蛋白质相互作用，C端激活下游靶基因。共聚焦观察显示 RLM1 确实定位于细胞核并充当转录因子。为了确定可能受 RLM1 直接调控的靶位点，我们使用以转录...
与其他植物相比,玉米中R2R3型M YB转录因子的保守域和其他植物类似,极少有缺失或插入,且R2和R3重复区的M YB保守氨基酸序列也包括一系列分布均匀、且高度保守的色氨酸残基。2玉米R2R3型M YB转录因子群体分类Du等利用生物信息学方法并根据同源序列和拓扑结构鉴定出玉米中158个典型的R2R3型M YB转录因子。汇集鉴定出的...
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此外,酵母单杂交试验、双荧光素酶试验和电泳迁移率变化试验证实 PsMYB30 可以与花青素合成酶 (ANS) 基因的启动子结合并增强其表达。总之,一种新的MYB转录因子PsMYB30被鉴定为通过激活参与花青素生物合成的PsANS的表达来促进花瓣斑的形成,这为植物中花瓣斑的形成提供了新的见解。
为了解陆生植物R2R3-MYB转录因子的组成和演化历史,该研究对代表性物种的R2R3-MYB转录因子进行系统发生分析,结果显示陆生植物的R2R3-MYB蛋白包含10个亚家族 (图1A) ,其中7个亚家族的序列在一些绿藻类植物 (chlorophytes) 和轮藻类植物 (charophytes) 中被鉴定到。这一结果说明,部分R2R3-MYB亚家族在植物登陆之前已...