boxplot(df1, col = c("green","yellow","purple"),names = c("Sample1","Sample2","Sample3"), xlab = "Sample names", ylab = "Values", main ="BOXPLOT")##做箱图的函数boxplot(),括号中首先是数据,然后箱图颜色,按照顺序一次注明颜色即可,然后就是样本名称注释,也是按照顺序一次,注意格式,最...
箱线图(box plot)主要从四分位数的角度展示数据的分布,最大值(Q4)、上四分位(Q3)、中位数(Q2)、下四分位数(Q1)和最小值(Q0)5个位置来获取一维数据的分布概况。 1、系统环境为Windows 官网下载安装R语言和Rstudio https://cloud.r-project.org/ https://github.com/rstudio/rstudio 2、安装绘图用的...
p<-ggplot(data_m,aes(x=variable,y=value),color=variable)+geom_boxplot(aes(fill=factor(variable)))+theme(axis.text.x=element_text(angle=50,hjust=0.5,vjust=0.5))+theme(legend.position="none")p # 图会存储在当前目录的Rplots.pdf文件中,如果用Rstudio,可以不运行dev.off()dev.off() 再看看V...
p <- ggplot(data_m, aes(x=variable, y=value),color=variable) + geom_boxplot(aes(fill=factor(variable))) + theme(axis.text.x=element_text(angle=50,hjust=0.5, vjust=0.5)) + theme(legend.position="none") p # 图会存储在当前目录的Rplots.pdf文件中,如果用Rstudio,可以不运行dev.off() ...
当我在R-Studio中运行我的boxplot时,它的输出是正确的,但当我使用knit时,它扭曲了其中一个框: R-Studio中的输出: 针织文件中的输出: 这在word和html格式中都会发生。我把针织无花果弄得团团转。size配置和ggplot2 w和h配置,但问题似乎出在设备?绘图代码如下所示,这个bug在rmarkdown 1.8...
在R studio主界面选中Packages-Install,输入ggplot2,点击Install就开始下载了。 输入代码,就可以绘制图箱线图了,点击Export就可以将图导出了。 boxplot(Drive) 从处理的速度来看,R语言比excel优势大多了,一般的电脑遇到几万条数据,excel直接卡着不会动了。R语言完全没有卡顿。值得注意的是,本文的箱线图是做个一维...
geom_boxplot() + theme(axis.text.x=element_text(angle=50,hjust=0.5, vjust=0.5)) + theme(legend.position="none") p # 图会存储在当前目录的Rplots.pdf文件中,如果用Rstudio,可以不运行dev.off() dev.off() 箱线图出来了,看上去还可以,再加点色彩 ...
为了推广,也为了激起大家的热情,如果想要sp_boxplot.sh脚本的,还需要劳烦大家动动手,转发此文章到朋友圈,并留言索取。 也希望大家能一起开发,完善功能。 R绘图学习 R语言学习 - 入门环境Rstudio R语言学习 - 热图绘制 (heatmap) R语言学习 - 基础概念和矩阵操作 ...
最近遇到如何在boxplot基础上展示两组数据的FoldChange的问题,最后通过结合热图的方式解决了该问题。 加载R包 library(dplyr)library(tibble)library(data.table)library(ggpubr)library(cowplot) 导入数据 phen<-read.csv("phenotype.csv")dat<-read.table("data.txt",header=T,row.names=1,sep="\t") ...
上述代码中,首先利用ggplot2包中的geom_boxplot()函数绘制了箱线图。然后利用ggtitle()、xlab()、ylab()函数分别设置图形的标题、x轴标签和y轴标签。 2. 散点图 散点图是一种用于展示两个变量之间关系的图形。散点图可以用于展示线性相关性、非线性相关性或无关性。