当用ggpubr::stat_cor和输出十进制设置为逗号(选项(OutDec= ","))绘图时,出现意外的逗号“。 、、、 在使用选项命令将输出十进制设置为逗号后,当使用stat_cor函数包含Pearson时,将得到以下错误: Error in parse(text = text[[i]]) : <text>:1:16:因此,我尝试将,decimal.mark = ","和, labels...
首先计算相关系数,然后使用函数annotate添加: library(ggplot2)data(mtcars)df<-mtcars df$cyl<-as.factor(df$cyl)cor.test(df$mpg,df$wt)b<-ggplot(df,aes(x=wt,y=mpg))# Scatter plot with regression lineb+geom_point()+geom_smooth(method="lm")+annotate("text",label="Pearson:R==-0.8677~p<...
同时,需要设置stat_poly_eq()中geom = “text”。此外,在指定的(label.x, label.y)位置处显示文本,stat_cor()默认为左对齐,而stat_poly_eq()默认为居中对齐,为了保持一致,需将stat_poly_eq()也设置为左对齐,即hjust = 0。(注:hjust=0表示左对齐,hjust=1表示右对齐,hjust=0.5表示居中对齐) 上图是通过...
散点图上添加相关系数及p值 #使用ggpubr包中的stat_cor()函数 #在散点图上直接标记相关系数以及p-value ggplot(iris,aes(x = Sepal.Length, y = Sepal.Width))+ geom_point()+ geom_smooth(method = "lm", se = F, color = "red")+ theme_classic()+ stat_cor(data = iris, method = "spea...
stat_cor(method = "spearman",size = 8) + theme 手动计算的结果与原文相似性更高,很有意思 EMT基因来源 —— 网页数据库EMTome(http://www.emtome.org/) 该数据库主要包括五个模块:EMT Signature、EMT Genes、EMT Interactome、EMT Score、CRISPR/DRUG Response: ...
# 这里用到 stat_cor() 函数,必须加载 ggpubr 包# 我们也可以先了解一下该函数?stat_corp7_2 <- p7_1 + stat_cor (aes(colour = fl), method = "pearson", #用pearson相关性分析,可以自行更改方法 label.x = 3) #在 x = 4 的地方表示相关性信息p7_2#7) 利用数据对各类模型进行拟合,再...
1、基础散点图绘制 library(ggplot2)p1<-ggplot(iris,aes(Sepal.Length,Sepal.Width,color=Species))+geom_point()+theme_bw()p1 image.png 2、具有相关性的散点添加拟合曲线并添加相关系数——使用到了ggpubr包中的stat_cor函数 library(ggpubr)p1+facet_wrap(~Species)+geom_smooth(method=lm)+stat_cor...
ggplot是一个用于数据可视化的R语言包,而stat_cor是ggplot中的一个函数,用于在图表中显示相关系数。 相关系数是用来衡量两个变量之间相关程度的统计量,它的取值范围在-1到1之间。相关...
函数cor.test()可以对单个的Pearson、Spearman和Kendall相关系数进行检验。其中的参数x和参数y为要检验相关性的变量,参数alternative则用来指定进行双侧检验或单侧检验(取值为"two.side"、"less"或"greater"),而参数method用以指定要计算的相关类型("pearson"、" kendall"或"spearman" )。当研究的假设为总体的相关系...
aes(group = 1))+ #添加相关性检验结果 stat_cor(label.y = -2.2,size = 6, ...