打开RStudio或R控制台 输入以下代码安装“qvalue”包: install.packages("qvalue") 1. 这行代码的作用是从CRAN(Comprehensive R Archive Network)仓库中安装qvalue包。 加载已安装的“qvalue”包: library(qvalue) 1. 这行代码的作用是加载已安装的qvalue包,让你可以在R中使用qvalue包提供的函数和工具。 类图...
步骤1: 安装 qvalue 包 首先,你需要安装 R 语言的 qvalue 包。如果你还没有安装 R,你可以在官方网站上下载并安装 R: 在R 中,你可以使用以下代码安装 qvalue 包: install.packages("qvalue") 1. 这将会在你的计算机上安装 qvalue 包,以便后续的使用。 步骤2: 导入数据 接下来,你需要导入你的数据。假...
macports-packages-R-qvalue安装包是阿里云官方提供的开源镜像免费下载服务,每天下载量过亿,阿里巴巴开源镜像站为包含macports-packages-R-qvalue安装包的几百个操作系统镜像和依赖包镜像进行免费CDN加速,更新频率高、稳定安全。
stringi qvalue 备注R语言包的安装教程 # 简介 R语言包在线安装比较简单,离线安装相对麻烦,尤其是解决依赖问题,本文介绍在线和离线安装R语言包的方法。 # 安装包 # Linux系统R语言包在线安装 在Shell命令行终端输入R, 打开R的控制台, 输入: # 安装 gridExtra install.packages("gridExtra", dependencies = TRUE)...
qpdf 534 quadprog 535 quantmod 536 quantreg 537 qvalue 538 qvcalc 539 R.methodsS3 540 R.oo 541 R.utils 542 R6 543 randomForest 544 ranger 545 RANN 546 rappdirs 547 rat2302.db 548 RBGL 549 rbibutils 550 rcmdcheck 551 RColorBrewer 552 rcompanion 553 rcorpora 554 Rcpp 555 RcppAnnoy ...
完全可以多个R包一起安装 ins_pac = c("DO.db", "fgsea", "qvalue", "ggforce", "DOSE", "ggraph", "GOSemSim", "biomaRt", "enrichplot", "GenomicFeatures", "gridBase", "rtracklayer", "TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene") install.packages("ins_pac", repo=site) ...
一口气安装800个R包 我们周末班准备工作主要就是希望大家学会安装R包http://www.bio-info-trainee.com/3727.html 首先配置中国大陆特色镜像 如果是在海外网络,通常是不需要选择我们这里的代码里面的清华大学和中科院镜像: options()$repos options()$BioC_mirror...
qvalueCutoff = 0.05,#设定q值阈值 readable = T 可执行GO查看GO分析的结果,也可以保存到本地. 2.4 KEGG分析: KEGG<-enrichKEGG(gene$ENTREZID,#KEGG富集分析 organism = KEGG_database, pvalueCutoff = 0.05, qvalueCutoff = 0.05) 可执行KEGG查看KEGG分析的结果,也可以保存到本地. ...
Error in library(apeglm) : 不存在叫‘apeglm’这个名字的程辑包 BiocManager::install("apeglm")测试 library(DESeq2) #加载包 library(apeglm)安装成功。以下为差异基因表达分析的相关脚本:pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。qvalue(p-adjusted): 校正后的p值(qvalue=padj=FDR=...
library(DESeq2) #加载包 library(apeglm) 安装成功。 以下为差异基因表达分析的相关脚本: pvalue(pval): 统计学差异显著性检验指标。 qvalue(p-adjusted): 校正后的p值(qvalue=padj=FDR=Corrected p-Value=p-adjusted),是对p值进行了多重假设检验,能更好地控制假阳性率。