make_option,用于选项声明,包括 flags, types, default values 以及 help messages。 OptionParser,用于读取传递给 R 脚本的参数。 parse_args,用于根据make_option的声明对OptionParser传递的参数进行解析。 下面,我们以创建一个名字为 testScript-2.R 传递参数程序为例,对 optparse 的使用进行详细说明。 创建testScr...
optparse使得我们很方便地给R脚本设置命令行参数,从而使得R脚本的复用和流程化使用。 1 安装 install.packages("optparse")library("optparse") 2 使用 创建参数列表:make_option # Usagemake_option(opt_str,# 参数名,格式:--parameter_nameaction=NULL,# 描述optparse在遇到选项“store”、“store-true”、“stor...
1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls a.txt test.r root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2#cat test.r#!/usr/bin/Rscript library(optparse) option_list<-list( make_option(c("-a","--aa"), type ="character"), make_option(c("-b","--bb"), type ="integer") ) opt_parser= Op...
1, 加载optparse包 2, 设置参数, 为list 3, 解析参数 4, 如果参数为空, 打印帮助文档 #!/usr/bin/Rscript library(optparse) option_list <- list( make_option(c("-a", "--aa"), type = "integer", default=FALSE, help="Input a number"), make_option(c("-b", "--bb"), type="intege...
parse_args,用于根据make_option的声明对OptionParser传递的参数进行解析。 下面,我们以创建一个名字为 testScript-2.R 传递参数程序为例,对 optparse 的使用进行详细说明。 创建testScript-2.R,利用 optparse 定义参数 #!/usr/bin/env Rscript library("optparse") ...
Error in make_option("-s", type = "character") : We require a long flag option 注意:optparse包可以设置数组,但命令行运行不能传递(至少我没找到方法,如果有知道如何解决的,可以评论区说一下) # test.R option_list = list(make_option("--string",type = "character",default = c("a","b")...
library(optparse)# 需要用户自己事先安装option_list<-list(# -n 为短参数 --name为参数调用时的名称,type:数据类型, action默认store就行,其他顾名思义。make_option(c("-n","--name"),type="character",default=NULL,action="store",help="项目名称,必须设置,最好简短且有意义"),make_option(c("-...
其中最重要的参数是option_list,这个参数接受一个列表,这个列表是被用来描述命令参数的解析方式的。 下面是一个例子,将下列代码存到test.R文件中: library(optparse)# 描述参数的解析方式option_list<-list(make_option(c("-f","--first"),type="integer",default=FALSE,action="store",help="This is first...
library(optparse) # 需要用户自己事先安装 option_list <- list( # -n 为短参数 --name为参数调用时的名称,type:数据类型, action默认store就行,其他顾名思义。 make_option(c("-n", "--name"), type = "character", default = NULL,
Package‘optparse’October14,2022 Encoding UTF-8 Type Package Title Command Line Option Parser Version1.7.3 Description A command line parser inspired by Python's'optparse'library to be used with Rscript to write``#!''shebang scripts that accept short and longflag/options.License GPL(>=2)...