("optparse") install.packages("tidyverse") install.packages("rvest") install.packages("multiUS", repos="http://R-Forge.R-project.org") install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/locfit/locfit_1.5-9.4.tar.gz",repos = NULL,type = "source") install.packages("https...
1、直接安装 conda安装R包 conda install r-ggplot2 (1)对于一般的R包 install.packages("package name") (2)对于Bioconductor的包(使用BiocManager安装)先装BiocManager,再安装所需R包即可。 if(!requireNamespace("BiocManager",quietly=TRUE))install.packages("BiocManager")BiocManager::install("package name") ...
首先安装optparse包 install. Packages(‘optparse’) 接着在我们编写好的脚本中,写好我们的函数 假设我们的脚本名称为Afunction.R 里面有下面这样的函数 Afunction<-function(x,y){……}#这个函数有两个参数 x和y 要想将其变成方便的小工具我们需要将这个脚本变成这样: library('optparse')#调用optpares包option...
# 1.在R的控制台,输入 install.packages("servr") # 安装 servr install.packages("servr", contriburl="http://www.your.url", dependencies = TRUE) # 安装 servr # 2.若要指定安装目录 (e.g. “mydir”),则输入 install.packages("stepNorm", contriburl="http://www.biostat.ucsf.edu/jean/soft...
方法二:optparse包方法 通过加载optparse包进行参数设置,这种方法类似与python中argparse方法设置参数,如果不是简单的一两个参数推荐这种方法调用参数。 这种方法,可以设置默认值,指定参数数据类型,帮助信息。 library(optparse)# 需要用户自己事先安装option_list<-list(# -n 为短参数 --name为参数调用时的名称,type:...
package_list <- c("optparse","reshape2","ggplot2","devtools","bindrcpp","ggthemes") for(p in package_list){ if(!suppressWarnings(suppressMessages(require(p, character.only = TRUE, quietly = TRUE, warn.conflicts = FALSE))){ install...
install_package <- c("RColorBrewer", "gplots", "agricolae","optparse") # 判断包是否存在,不存在则安装 for (i in install_package) { if (!i %in% a) BiocManager::install(i, update = F) } 1. 2. 3. 4. 5. 6. 7. 8. 9. ...
包的载入library()或require(),安装完包后,需要加载才能使用其中的函数,此时括号中不使用引号。两者的不同之处在于library()载入之后不返回任何信息,而require()载入后则会返回TRUE,因此require()适合用于程序的书写。例如: library(ggplto2) > require(foreign) Loading required package: foreign > is.log...
包的载⼊library()或require()，安装完包后，需要加载才能使⽤其中的函数，此时括号中不使⽤引号。两者的不同之处在于library()载⼊之后不返回任何信息，⽽require()载⼊后则会返回TRUE，因此require()适合⽤于程序的书写。例如：library(ggplto2)> require(foreign)Loading required package: ...
对于参数的位置是可变的，在 R所在路径 和 R脚本的路径 这两个参数之间是Rscript的参数，这些参数的数量是 可变的. 输入的参数是从第 6 个开始 这样一来就会导致R脚本的参数的索引不固定，针对这种情况，你也可以添加一个参数来削掉R脚本参数之前的参数了。Python模块学习——optparse 使用之前安装...