孙前文实验室在半自主细胞器R-loop生物学功能和调控机制亦有一系列研究工作,包括AtRNH1C与RHON1调控转录-复制正面对撞、AtRNH1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在拟南芥叶绿体中协作完成DNA损伤修复、发现了一种叶绿体和线粒体信息交换的新机制以保证线粒体基因组的完整性和早期胚胎发育的正常进行等(The Plant...
Nat Commun丨发现S9.6单克隆抗体特异识别R-loop的结构机制 R-loop(R环)是细胞内普遍存在的动态三链核酸结构,在DNA复制与修复、染色质与转录调控、端粒维持、介导CRISPR以及长非编码核糖核酸(lncRNA)基因组定位中发挥着重要作用[1-4]。R-loop...
为了测试当R-loop被诱导时,哪些先天免疫传感器介导IRF3的激活,作者们在SETX敲除型细胞中分别敲除了TLR3、RIGI、MDA5或cGAS,发现抑制cGAS和TLR3能够强烈降低磷酸化的IRF3以及下游效应因子,但是抑制RIGI或MDA5的影响并不大。这些结果表明R-loop诱导的IRF3信号主要是由cGAS和...
最近,Lieber 小组对 R-loop 在 CSR 中的作用进行了优雅而系统的研究,其中小鼠 B 细胞系 CH12 中的 IgH Sα 序列被具有不同 R-loop 形成强度和 AID 热点密度的人工序列所取代。 他们发现,在没有 R-loop 形成的情况下,高密度的 AID 热点会导致 CSR 效率低下,但 AID 热点密度和 R-loop 形成强度的结合...
现代医学不断探索细胞分子机制,而R-Loop的发现,恰恰为我们揭开了这一领域的神秘面纱。R-Loop,这一DNA和RNA的特殊三链结构,正在改变我们对基因表达及其调控的理解。它不仅集中于最活跃的基因上,而且与基因组的稳定性、细胞的生命活动息息相关。 在日常生活中,对基因表达、DNA损伤和免疫反应的认识逐渐深入。例如,...
此外,近期的几项研究进一步揭示了 R-loop 与肠道干细胞、抗肿瘤免疫反应之间的关系。ARID1A 蛋白的失活可能引发 R-loop 的增生,进而诱导抗肿瘤免疫表型的形成。这一发现为癌症免疫治疗开辟了新的路径,而 DHX9 蛋白在炎症性肠病(IBD)中的调控机制则显示了 R-loop 在不同生物过程中扮演的多重角色。
近日,美国斯坦福大学Karlene A. Cimprich研究组在Nature发表了文章R-loop-derived cytoplasmic RNA–DNA hybrids activate an immune response,发现在细胞质中存在一种新型R-loop,是R-loop加工过程中的产物。此类R-loop会作为免疫原导致免疫反应激活,这一过程会导致的许多疾病的发生。
R-loop 是由一条RNA:DNA杂合链和一条单链DNA构成的三链核酸结构。它在转录调控、免疫球蛋白类别转换、端粒维持、DNA损伤以及损伤修复等过程中发挥重要作用。tRNA主要参与蛋白质的翻译合成,作为经典的非编码RNA,其被深入研究已有半个世纪之久。前期研究发现R-loop在拟南芥中普遍存在,与大多数基因同时含有正义R-loop和...
“线粒体RNase H1蛋白通过调节R-loop稳态以维持基因组完整性并确保拟南芥早期胚胎发生(Mitochondrial RNase H1 activity regulates R-loop homeostasis to maintain genome integrity and enable early embryogenesis in Arabidopsis )”为题的研究论文,发现了一种内共生半自主细胞器之间的新型交流机制,并揭示了RNase H1蛋白...
2020年1月7日,清华-北大生命科学联合中心、清华大学生命学院孙前文实验室在Cell Reports杂志在线发表题为“RHON1共转录移除R-loop以维持拟南芥叶绿体基因组稳定性 (RHON1 co-tranionally resolves R-loops for Arabidopsis chloroplast genome maintenance)”的研究论文。