近年来,随着一系列R-loop高通量测序技术的开发和研究体系的建立,植物中R-loop的研究已取得了长足的进步。 JIPB近日在线发表了清华大学孙前文实验室题为“R-loops: A new genome regulatory element in plants”的特邀综述文章(https://...
本研究是继报道一种精准、广谱、高效的全基因组R-loop检测新方法(Nature Plants 2017)、绘制拟南芥不同发育时期及环境刺激下的全基因组R-loops动态变化图谱(The Plant Cell, 2020)、合作发现OsTOP1共转录去除R-loops的效率会影响水稻根发育和向地性生长(Molecular Plant, 2017)、合作发现一个全新的R-loops阅读器A...
reviewing recent research advances on R-loops in plants.Furthermore,we provide perspectives on future research directions for R-loop biology in plants,which might lead to a more comprehensive understanding of R-loop functions in plant genome regulation and contribute to future agricultural improvements....
然而tRNA基因区R-loop的调控机制和相关的生物学功能仍然未知。 2021年09月01日,清华大学生命学院孙前文研究组在The Plant Cell的在线发表了题为Intragenic tRNA-promoted R-loops orchestrate transcription interference for plant oxidative stress responses的研究论文,揭示了基因内tRNA R-loops通过调控RNA聚合酶之间的...
然而tRNA基因区R-loop的调控机制和相关的生物学功能仍然未知。 2021年09月01日,清华大学生命学院孙前文研究组在The Plant Cell的在线发表了题为Intragenic tRNA-promoted R-loops orchestrate transcription interference for plant oxidative stress responses的研究论文,揭示了基因内tRNA R-loops通过调控RNA聚合酶之间的转录...
本研究是孙前文实验室继报导R-loop调节长非编码RNA表达并影响拟南芥开花(Science, 2013)和R-loop调控水稻根的向地性(Molecular Plant, 2017)之后的又一重要成果。ssDRIP-seq这种精准、高效、高通量R-loop检测技术的建立为随后的功能研究提供了重要手段,将成为全基因组R-loop分析的标准,并全面打开全基因组水平分析R...
本研究是孙前文实验室继报导R-loop调节长非编码RNA表达并影响拟南芥开花(Science, 2013)和R-loop调控水稻根的向地性(Molecular Plant, 2017)之后的又一重要成果。ssDRIP-seq这种精准、高效、高通量R-loop检测技术的建立为随后的功能研究提供了重要手段,将成为全基因组R-loop分析的标准,并全面打开全基因组水平分析R...
防止转录-复制正面对撞诱发的R-loop积累对细菌、植物以及哺乳动物基因组稳定性的维持至关重要。 孙前文实验室前期已经鉴定了一个RNase H1类的R-loop移除酶AtRNH1C可以与DNA Gyrase互作降解R-loop中的RNA,从而有效地松弛HO-TRCs以稳定叶绿体...
孙前文实验室进一步绘制了拟南芥在不同发育时期以及各种胁迫响应下的R-loop图谱,并揭示了拟南芥R-loop特有的动态变化特征。 2020年2月19日,清华-北大生命中心孙前文实验室在《植物细胞(The Plant Cell)》发表题为“拟南芥不同发育时期和胁迫响应下的R-loop图谱”(The R-loop atlas of Arabidopsis development and res...
Identifying how R-loops are generated is crucial to know how transcription compromises genome integrity. We show by genome-wide analysis of conditional yeast mutants that the THO transcription complex, prevents R-loop formation in G1 and S-phase, whereas