05、R-loop的生理病理功能 根据R-loop的作用,可将其大致分为生理性或“调节性”的R-loop和病理性或“非计划性”R-loop。调节性R-loop与基因调节和基因组稳定性相关,通过调节转录活性、复制、重组、着丝粒功能和DNA编辑等来调节基因活性。同时,调节性R-loop还通过促进修复DNA双链断裂(DSB)和短端粒结构来稳定基因...
R-loop,即由RNA:DNA杂交链与一条被置换的单链DNA构成的特殊三链核酸结构,广泛存在于从动物、植物到细菌等各类生物体的基因组中。现有研究指出,R-loop作为细胞内的关键调节因子,在DNA复制、同源重组、DNA损伤修复及转录等核心生理过程中具有重要作用。在我们先前的文章《特殊DNA-RNA互作R-loop丰富基因转录的表观...
R-loop,即由RNA:DNA杂交链与一条被置换的单链DNA构成的特殊三链核酸结构,广泛存在于从动物、植物到细菌等各类生物体的基因组中。现有研究指出,R-loop作为细胞内的关键调节因子,在DNA复制、同源重组、DNA损伤修…
现有研究指出,R-loop作为细胞内的关键调节因子,在DNA复制、同源重组、DNA损伤修复及转录等核心生理过程中具有重要作用。 在我们先前的文章《特殊DNA-RNA互作R-loop丰富基因转录的表观调控机制》中,我们深入分析了R-loop对基因表达调控的‘双刃剑’特性,即其既能促进也能抑制基因表达,并且在基因表达调控层面展现了多层...
为此,美国南卡罗来纳大学Makoto Taniguchi以及Christopher W.Cowan研究组合作在Science上发文题为A long noncoding eRNA forms R-loops to shape emotional experience–induced behavioral adaptation,发现了一个长链非编码增强子RNA通过形成R-loop调节情绪体验后的适应性行为,揭开了R-loop在调节生理功能的作用机制。
具有功能角色的DNA-RNA杂交体需要调控的需求,也由存在特定蛋白质因子的事实所示,这些因子有利于DNA-RNA杂交体的积累。因此,DDX1解旋酶解开在IgH S区转录物中发现的G4结构,使RNA与DNA杂交,从而提供了AID作用所需的ssDNA底物,然后进行类切换重组(Ribeiro de Almeida等人,2018年)。同样,DHX9 RNA解旋酶在剪接体缺陷条...
R-loop作为一个高度动态、调控精细、功能强大且普遍存在的结构,探索其调控机制和功能可以帮助我们更深入了解基因组上多种多样的生理过程[8]。对R-loop的研究加深了对基因组稳定性和基因表达调控的理解,也为我们对癌症等疾病的研究提供了新的方向和思路。
R-loop 是由一条RNA:DNA杂合链和一条单链DNA构成的三链核酸结构。它在转录调控、免疫球蛋白类别转换、端粒维持、DNA损伤以及损伤修复等过程中发挥重要作用。tRNA主要参与蛋白质的翻译合成,作为经典的非编码RNA,其被深入研究已有半个世纪之久。前期研究发现,R-loop在拟南芥中普遍存在,与大多数基因同时含有正义R-loop...
以及表观修饰等重要生物学过程有着密不可分的关系.很多因素参与对R-loop的调控,例如RNA转录和加工,染色体的修饰,DNA损伤反应等;同时,许多酶蛋白,如核糖核酸酶,解旋酶和拓扑异构酶等也参与调节细胞内的R-loop水平.了解R-loop的调控机制及其生物学功能有助于更好地理解基因组稳定性的维持机制,为治疗骨髓增生异常...
进一步地,作者们发现在Npas4基因组区域R-loop会调节启动子-增强子环形成,并且该环状结构形成会调节Npas4的表达。为了检测Npas4以及R-loop对于行为适应性的功能,作者们通过腺病毒AAV2表达敲低Npas4 eRNA或者mRNA会导致情绪体验适应性行为的变化。通过...