比如,对于一个数值x,其log10变换可以使用以下公式表示: [ y = \log_{10}(x) ] 在R语言中,可以使用内置函数log10()来实现这一转化。 R语言代码示例 假设我们有一个包含一组数据的向量,以下是进行log10对数转化的代码示例: # 创建一个包含数值的向量data<-c(1,10,100,1000,10000)# 对数据进行log10对数...
acosh(),asinh(),atanh() log(x,base=n),对x取以n为底的对数 log(x):自然对数ln log10(x):常用对数log exp() 这里的例子都很容易列举,所以就不展示了。 注意:对向量使用这一类数学函数会返回同样形状的向量,函数会作用到向量的每一个值。 数理统计函数 下面列举的是一类数理统计中计算统计量的常用函数...
R语言对数据进行log10对数转化 # R语言对数据进行log10对数转化 在数据分析中,对某些特征进行对数转换是一项常见的任务。这种转换通常用来处理偏态分布的数据,使其更符合正态分布的假设,从而便于后续分析。R语言作为强大的统计分析工具,提供了方便快捷的方法进行log10对数转化。本文将介绍如何在R中进行这一操作,并展...
log(m,n)对数函数,返回n的几次方为m log10(m)相当于log(m,10) round (n, m)对 n 保留 m 位小数四舍五入 ceiling (n)对 n 向上取整 floor (n)对 n 向下取整 数据类型 R 语言中的最基本数据类型主要有三种: 数字:一般形式或科学计数法 逻辑:布尔型(TRUE 、FALSE) 文本:字符串String,包含在单引...
log10() #以10为底的常用对数 2.4 平方根运算sqrt(),如图所示 2.5 指数运算exp(),表示以e为底的指数运算。如图所示 2.6 三角函数的运算函数。 sin() #正弦 cos() #余弦 asin() #反正弦 acos() #反余弦 atan() #反正切 sinh() #双曲正弦 ...
#-P:若为TRUE,则表示对<-y>指定的列进行-log10转换 #-L:指定图例的位置 #-s:指定差异基因列 #-S:指定差异基因列不同的标签出现的顺序 sp_volcano.sh-f volcano.txt-x log2FoldChange-y padj-s significant-S"'EHBIO_UP', 'Baodian_UP', 'Unchanged'"-PTRUE-Ltop ...
(A)$name,]# 筛选对应OTU属性df_igraph_size2=log10(df_igraph_size)#数据进行转换V(A)$Abundance=df_igraph_size2#加入物种信息,使用不同颜色表示data2=read.table(file="Genus_otu.txt",sep="\t",header=T,check.names=FALSE,row.names=1)data2$Tax_Genus[which(data2$Tax_Genus!='Pantoea'&data...
内置转换函数: scale_x_log10(), scale_y_log10() : for log10 transformation scale_x_sqrt(), scale_y_sqrt() : for sqrt transformation scale_x_reverse(), scale_y_reverse() : to reverse coordinates coord_trans(x =“log10”, y=“log10”) : possible values for x and y are “log2...
将数据转换为想要的形式,再进行作图,最常见的是取对数。它跟scale_x_log10()函数还是有区别的。 后者等价于先将数据取对数,再拿进来处理 前者则是其他处理优先,最后作图时再取对数。 我们拿拟合曲线举例子 我们如果用scale_x_log10就相当于把x的数据取了对数放进来做回归,拟合出一条直线。
在Transform,Normalize下选择Transform选项,点击OK。在随后弹出的Parameters:Transform界面框选中Standard functions单选按钮,并勾选Transform Y values using Y=-1*log(Y),则可以将纵坐标转换为-log10Padj,可在左侧Results部分查看转换后的结果。这样,我们期待已久的最原始的火山图轮廓就呈现出来了。