#检查当前Seurat版本: packageVersion('Seurat') 01 单样品读入 这里我们以GSE251912为例,单个样本标准文件读入V4和V5差别不大,大家下载需要的样品文件到本地,记得修改好文件夹名和文件名(barcodes.tsv.gz,features.tsv.gz,matrix.mtx.gz)。 #指定数据所在目录: data_dir<-"GSE251912/Cytokines/" #列出目录下文...
packageurl='http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/src/contrib/BiocGenerics_0.32.0.tar.gz'>install.packages(packageurl,repos=NULL,type='source')Installingpackageinto ‘C:/Users/wlx/Documents/R/win-library/3.6’(as‘lib’isunspecified)trying URL'http://www.bioconductor.org/packages/rele...
By default for a source install, the library directory is ‘locked’ by creating a directory ‘00LOCK’ within it. This has two purposes: it prevents any other process installing into that library concurrently, and is used to store any previous version of the package to restore on error. A...
sqlPackages <- rxInstalledPackages(fields = c("Package", "Version", "Built"), computeContext = sqlServer) 在SQL Server 上安装包此示例将 forecast 包及其依赖项安装到计算上下文。R 复制 pkgs <- c("forecast") rxInstallPackages(pkgs = pkgs, verbose = TRUE, scope = "private", computeContext...
require(installr) updateR() 是否更新,选“是”→ 是否查看更新细则和内容,选“否”→ 是否在“Rgui”中更新选“否”(图2)。 图2 记得在更新完R之后在R studio中选择最新版本的R:Tools→Global Options→General→R version(图3)。 图3 再次键入“version”即可得4.3.1版本(图4)。
这也意味着,从此可以使用install.packages("bruceR")来安装了! 用过老版本bruceR的朋友都有体会:若从GitHub安装,非常耗时间,过程也非常坎坷。现在,bruceR大大缩减了依赖包的数量,并且有了CRAN官方收录,安装会变得更容易! CRAN - Package bruceRcran.r-project.org/package=bruceR bruceR package - RDocumenta...
在R语言中,我们可以使用install.packages()函数来安装R包。例如,我们要安装名为“dplyr”的R包,可以使用以下代码: install.packages("dplyr") 1. 安装R包时,R会自动从CRAN(The Comprehensive R Archive Network)仓库下载并安装R包的最新版本。如果你想安装某个特定版本的R包,可以通过version参数指定版本号。例如,...
BiocManager::install("clusterProfiler") 出现package ‘XXX’ is not available for this version of R报错的解决思路: 1、检查包的名字是否拼写错误,注意大小写,R是区分大小写的。 2、选择正确的“源”位置,用setRepositories()命令设置“源”的位置: ...
如果你需要某个包的旧版本,那么可以使用package_version参数指定版本: require(devtools) devtools::install_version("包名", version = "版本号") 网络问题 网络问题,如连接超时或是代理设置,也是安装包时可能遇到的问题。确保你的网络连接稳定,并且适当配置代理设置。
例如我当前的survminer包版本是0.4.3,想换成0.4.2版本。而常规的install.packages函数并不支持版本的选择... 1.最简便的方法是使用devtools包中的install_version函数: require(devtools)install_version('survminer', version ='0.4.2') Downloading package from url:https://mirrors.tuna./CRAN/src/contrib/Archi...