在initialize()中,你指定你想应用聚类的任何矩阵以及分割变量,然后,下面的heatmap()调用都共享这个布局。 在下面的例子中,全局布局是由mat1决定的,它在第二个轨道中被可视化。我在第一个轨道中设置了side = "outside",实际上你可以发现树状图实际上是根据第二个轨道中的矩阵生成的。 circos.heatmap.initialize(...
circos.genomicInitialize()函数也是接受数据框型的输入数据,数据必须至少包含三列,第一列代表基因组分类,后两列为每种分类在基因组中的顺序 例如,基因的位置信息 df <- data.frame( name = c("TP53", "TP63", "TP73"), start = c(7565097, 189349205, 3569084), end = c(7590856, 189615068, 3652765)...
> nw <-network.initialize(n = 1000, directed = FALSE)> nw <-set.vertex.attribute(nw, "race", rep(0:1, each = 500))> formation <-~edges + nodefactor("race") + nodematch("race") +concurrent> target.stats <- c(250, 375, 225, 100)> coef.diss <-dissolution_coefs(dissolution =...
library(circlize) #圈图绘制 library(ComplexHeatmap) #这个包绘制图例 library(grid) #组合圈图和图例 pdf('circlize1.pdf', width = 8, height = 8) circle_size = unit(1, 'snpc') circos.par(gap.degree = 3, start.degree = 90) #染色体区域 circos.genomicInitialize(seq_stat, plotType = c...
param<-param.dcm(inf.prob=0.2,act.rate=seq(0.25,0.5,0.05),rec.rate=0.02)init<-init.dcm(s.num=500,i.num=1)control<-control.dcm(type="SIS",nsteps=350)mod<-dcm(param,init,control)head(as.data.frame(mod,run=5)) 代码语言:javascript ...
bpparam <- SnowParam(workers = 2) ## Initialize the streamer and iterator. fqs <- FastqStreamer(fl, n = 100) ITER <- fastqIterator(fqs) bpiterate(ITER, summary, BPPARAM = bpparam) 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 ## Results from the workers are combined on the ...
myDf2 <- data.frame(vec1, vec3, vec4) myDf3 < data.frame(vec1, vec2, vec3) library(datasets) # initialize library(help=datasets) # display the datasets #下面一些基本操作代码会经常用到 class(airquality) # get class sapply(airquality, class) # get class of all columns ...
myDf1 <- data.frame(vec1, vec2) # make data frame with 2 columns myDf2 <- data.frame(vec1, vec3, vec4) myDf3 < data.frame(vec1, vec2, vec3) library(datasets) # initialize library(help=datasets) # display the datasets #下面一些基本操作代码会经常用到 class(airquality) # get ...
InitializePhysicalUsersPool 失敗 此訊息可能表示您的安全性設定導致安裝程式無法建立執行外部指令碼所需的背景工作角色帳戶集區。 資訊安全內容管理員初始化失敗 附屬工作階段管理員初始化失敗 系統事件 開啟Windows 事件檢視器,然後在系統事件記錄檔中搜尋包含 Launchpad 字串的訊息。 開啟ExtLaunchErrorlog 檔案,並...
engine.Initialize(); } List<double> x; double[,] y=new double[5,5]; x = new List<double>(); for(int i=0;i<5;i++) { x.Add(i); for (int j = 0; j < 4; j++) { y[i, j] = i+i *i+5+j; } } var v1 = engine.CreateNumericVector(x); ...