Error: package or namespace load failed for‘ChIPseeker’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]): 不存在叫‘gplots’这个名字的程辑包 #安装这个包 > install.packages("gplots") #继续报错 Warning in install.packages : dependency ‘caTools’ is...
usethis v1.1.0: 自动化包和项目设置任务,包括建立单元测试,测试覆盖率,持续集成,Git,GitHub,许可证,RStudio项目等等,否则需要手动执行. xltabr v0.1.1: 它提供了可以使用[openxlsx](https://cran.r -project.org/package= openxlsx)来生成良好格式化的跨列表的函数,它已经被开发用来帮助自动化发布官方统计数据 ...
WVPlots:常见数据分析可视化绘制 gplots:提供可视化数据绘制工具 vioplot:小提琴图 rainbow:条形图、箱型图、彩虹图绘制 treemapify:在ggplot2中绘制树状图 ezplot:常见图表绘制函数集 spaceRGB:RGB定义工具 r2d3: 3D可视化工具 discoveR:通过shiny实现的可视化探索性数据分析接口,包括聚类、主成分分析等 scico:基于科...
R package gplotsWarnes, GRBolker, BBonebakker, LGentleman, RHuber, WLiaw, ALumley, TMaechler, MMagnusson, AMoeller, S
1.采用gplots包中的redblue配色方案,蓝色高表达,红色低表达 heatmap(data, cexCol = 1,scale="row",col = redblue(100)) 2.采用gplots包中的bluered配色方案,红色高表达,蓝色低表达 heatmap(data, cexCol = 1,scale="row",col = bluered(100)) ...
R 3.5版本 问题: install.packages("gplots") 时报错:ERROR: dependency 'caTools' is not available for package 'gplots' 解决办法:安装gpl
‘gmm’, ‘gplots’, ‘Rdpack’, ‘miscTools’, ‘RSpectra’, ‘AlgDesign’, ‘zip’, ‘CircStats’, ‘snowfall’, ‘rlecuyer’, ‘CARBayesdata’, ‘matrixcalc’, ‘MCMCpack’, ‘truncnorm’, ‘packcircles’, ‘scatterplot3d’,
聚类分析作图往往包含热图(heatmap)和树状图(dendrogram)。热图用来展示每个样本点数值大小和聚集模式。树状图用来表示样本之间以及变量之间的距离远近(或者相似性大小)。R官网目前提供了至少45个可以绘制热图的包(packages),其中比较常见的、可以添加行列注释信息条的聚类作图包有pheatmap、gplots等等。以下简单介绍一下对热...
树状图用来表示样本之间以及变量之间的距离远近(或者相似性大小)。R官网目前提供了至少45个可以绘制热图的包(packages),其中比较常见的、可以添加行列注释信息条的聚类作图包有pheatmap、gplots等等。以下简单介绍一下对热图(heatmap)和树状图(dendrogram)添加注释信息条(side bar)的方法(以mtcars数据集为例)。
https://ke.qq.com/course/package/37513 参考资料: ☞【R语言】热图绘制-heatmap函数 ☞R语言中的颜色(一)-自带的调色板 ☞R语言中的颜色(二)-gplots包 ☞超详细的热图绘制教程(5000余字),真正的保姆级教程 ☞R语言绘制基因表达热图(简易版) ...