3.2 使用gplots包 #install.packages ("gplots") library(gplots) heatmap.2(cor_matrix$r, trace = 'none', notecol = 'black', srtCol = 0, cellnote = pmt) heatmap.2(cor_matrix$r, col=bluered, scale="column", trace = 'none') 3.3 使用corrplot包 library(corrplot) coul=colorRampPalette...
Error: package or namespace load failed for‘ChIPseeker’ in loadNamespace(j <- i[[1L]], c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[j]]): 不存在叫‘gplots’这个名字的程辑包 #安装这个包 > install.packages("gplots") #继续报错 Warning in install.packages : dependency ‘caTools’ is...
heatmap(data, cexCol = 1,scale="row",col = bluered(100)) 3.采用gplots包中的redgreen配色方案,绿色高表达,红低表达 heatmap(data, cexCol = 1,scale="row",col = redgreen(100)) 4.采用gplots包中的greenred配色方案,红色高表达,绿低表达 heatmap(data, cexCol = 1,scale="row",col = gree...
gplots:绘制可视化数据的各种R编程工具 gplots包含绘制数据的各种R编程工具,如计算和绘制局部平滑的汇总函数(‘bandplot’,‘wapply’),标准绘制的增强版本(‘barplot2’,‘boxplot2’,‘heatmap.2’,‘smartlegend’),颜色设置(‘col2hex’,‘colorpanel’,‘redgreen’,‘greenred’,‘bluered’,‘redblue’,...
R 3.5版本 问题: install.packages("gplots") 时报错:ERROR: dependency 'caTools' is not available for package 'gplots' 解决办法:安装gpl
Package:devtools::install_github("taowenmicro/ggClusterNet") 11 limma包,vennDiagram函数 点评:这个包基本上可以略过,主要功能也不是为了绘制韦恩图,需要输入计算分类好的0-1矩阵。 12 gplots包,venn函数 点评:很简洁的韦恩图绘制,无法设置颜色,很单调。亦可忽略。
gplots:提供可视化数据绘制工具 vioplot:小提琴图 rainbow:条形图、箱型图、彩虹图绘制 treemapify:在ggplot2中绘制树状图 ezplot:常见图表绘制函数集 spaceRGB:RGB定义工具 r2d3: 3D可视化工具 discoveR:通过shiny实现的可视化探索性数据分析接口,包括聚类、主成分分析等 ...
R package gplotsWarnes, GRBolker, BBonebakker, LGentleman, RHuber, WLiaw, ALumley, TMaechler, MMagnusson, AMoeller, S
gplots:提供可视化数据绘制工具 vioplot:小提琴图 rainbow:条形图、箱型图、彩虹图绘制 treemapify:在ggplot2中绘制树状图 ezplot:常见图表绘制函数集 spaceRGB:RGB定义工具 r2d3: 3D可视化工具 discoveR:通过shiny实现的可视化探索性数据分析接口,包括聚类、主成分分析等 ...
gplots包中的plotmeans()可以用来绘制带有置信区间的组均值图形。如图9-1所示,图形展示了带有95%的置信区间的各疗法均值,可以清楚看到它们之间的差异。 library(gplots) plotmeans(response ~ trt, xlab="Treatment", ylab="Response", main="Mean Plot\nwith 95% CI") detach(cholesterol) 1. 2. 3. 4. 2-...