这里假定我们有两个基因集,并且想展示这两个基因集的共同基因和不同基因,具体代码如下: 代码语言:javascript 复制 install.packages("ggvenn")#安装ggvenn包library(ggvenn)#加载ggvenn包 gene_set1<-c("BIRC3","JUN","FOS","MAP3K14","MAP3K8","CREB5","CCL2","CCL20","CXCL1","CXCL3","CXCL5")...
现在有很多在线的网站都可以绘制,但是R来画也方便,其中ggvenn是基于ggplot2的专门绘制韦恩图的R包。 官方网站: https://github.com/yanlinlin82/ggvenn 1.安装 ggvenn在CRAN上,直接用Install.packages就可以完成安装: >install.packages("ggvenn")>library(ggvenn) 2.基础用法 ggvenn支持list和data.frame两种数据格式...
现在有很多在线的网站都可以绘制,但是R来画也方便,其中ggvenn是基于ggplot2的专门绘制韦恩图的R包。 官方网站:https://github.com/yanlinlin82/ggvenn 1.安装 ggvenn在CRAN上,直接用Install.packages就可以完成安装: > install.packages("ggvenn") > library(ggvenn) 2.基础用法 ggvenn支持list和data.frame两种数据...
安装完ggVennDiagram后,这个包可以直接library(ggVennDiagram)使用;但如果要使用sf包,则需要: 代码语言:javascript 复制 exportLD_LIBRARY_PATH=/Bioinfo/Pipeline/SoftWare/gdal-2.2.0/lib:/Bioinfo/Pipeline/SoftWare/geos-3.4.0/lib:/Bioinfo/Pipeline/SoftWare/proj-4.8.0/lib:$LD_LIBRARY_PATH...
R语言绘图包05--韦恩图的绘制:ggvenn和VennDiagram R语言绘图包06--基因表达相关性绘图corrplot R语言绘图包07--多集合可视化UpSetR R语言绘图包08--森林图的绘制:forestplot 序列分析图(sequence logo)的序列指的是核苷酸(DNA/RNA链中)或氨基酸(在蛋白质序列中)。sequence logo图是用来可视化一段序列某个位点的保...
首先,我们需要安装并加载ggVennDiagram包。可以使用以下代码来完成这一步: install.packages("ggVennDiagram")library(ggVennDiagram) 1. 2. 接下来,我们准备一些示例数据集,假设我们有两个包含数字的向量T和F,分别代表两个数据集。我们可以使用以下代码创建这两个向量: ...
为此,首先安装并加载 ggVennDiagram 包并以列表形式提供输入。然后,使用上述语法创建维恩图,自定义维恩图使用其他参数。 示例1: R实现 # load ggVennDiagram Package library("ggVennDiagram") # use list as an input x<-list('C++'=c(9,3,5,2),'Java'=c(7,8,4,3), ...
步骤1:下载并安装ggVennDiagram包 # 安装devtools包(如果未安装)if(!requireNamespace("devtools",quietly=TRUE)){install.packages("devtools")}# 安装ggVennDiagram包devtools::install_github("yanlinlin82/ggVennDiagram") 1. 2. 3. 4. 5. 6.
#安装加载需要的R包 options(stringsAsFactors = F) library(pacman) p_load(ggvenn, ggVennDiagram, UpSetR,data.table, stringr) # 安装相应的包 读取数据 list1 = read.table("diff_DESeq2_DEG.txt",header=T,sep="\t", stringsAsFactors=FALSE,check.names=F) ...
要在R语言中提取多个文件的共有元素和各自特有元素,并使用ggvenn包绘制韦恩图,可以按照以下步骤进行操作:确保你已经安装了R语言和所需的包(如dplyr和ggvenn)。如果还没有安装,可以使用以下命令安装:install.packages("dplyr")install.packages("ggvenn")将多个文件读入R中,并将它们存储为独立的数据框(或其他...