ggplot(midwest,aes(x=area, y=poptotal))# area 和 poptotal 是'midwest'中的列 aes()函数用来专门指定x和y轴,源数据框的任何信息都需要在这个函数中特意指定。 2 线性模型拟合散点图 1 2 3 library(ggplot2) g <-ggplot(midwest,aes(x=area, y=poptotal)) +geom_point() +geom_smooth(method="l...
sp<-ggplot(cars,aes(x=speed,y=dist))+geom_point()sp # Log transformation usingscale_xx()# possible valuesfortrans:'log2','log10','sqrt'sp+scale_x_continuous(trans='log2')+scale_y_continuous(trans='log2')# Sqrt transformation sp+scale_y_sqrt()# Reverse coordinates sp+scale_y_rever...
ggp <- ggplot(data, aes(x, y, col = group)) + # Create default ggplot2 plot geom_point() ggp # Draw ggplot2 plotAs shown in Figure 1, we have created a ggplot2 scatterplot with default legend items.Example 1: Change Legend Labels of ggplot2 Plot Using scale_color_manual Function...
dp <- ggplot(data=df, aes(x=date, y=price)) + geom_line()dp img 格式化日期标记 使用scales包: library(scales)# Format : month/daydp + scale_x_date(labels = date_format("%m/%d")) + theme(axis.text.x = element_text(angle=45))# Format : Weekdp + scale_x_date(labels = date...
这里以火山图为例进行说明,在转录组分析中,火山图是很常见的一类图,纵轴表示p_value,横轴表示log (fold change)。单一的散点图绘制很简单,火山图比较难处理的地方就是一些基因的注释,基因越多,加文本注释越困难,因为文字会堆在一起,看不清。 示例数据df1是转录组做差异表达后的部分结果,df2将logFC绝对值大于0....
#(3) Change the text color and size by groups #根据分组赋予颜色和大小 p1 <- sp2 <- ggplot(mtcars, aes(x=wt, y=mpg, label=rownames(mtcars)))+ geom_point() # Color by groups p2 <- sp2 + geom_text(aes(color=factor(cyl))) # Set the size of the text using a continuous variab...
3 ggplot2入门笔记3—通用教程如何自定义ggplot2 1. 添加图和轴标题(Adding Plot and Axis Titles) 2. 修改图例(Modifying Legend) 2.1 如何更改图例标题(How to Change the Legend Title) ...
这个R tutorial描述如何使用ggplot2包修改x和y轴刻度。同样,该文包含如何执行轴转换(对数化,开方等)和日期转换。 准备数据 使用ToothGrowth: # Convert dose column dose from a numeric to a factor variableToothGrowth$dose<-as.factor(ToothGrowth$dose)head(ToothGrowth)## len supp dose## 1 4.2 VC 0.5##...
ggplot(data=df, mapping=aes(x=Improved,y=Freq))+ geom_bar(stat="identity") 1. 2. 3. 4. 5. 绘制的条形图是相同的,如下图所示: 二,修改条形图的图形属性 条形图的图形属性包括条形图的宽度,条形图的颜色,条形图的标签,分组和修改图例的位置等。
1 ggplot2入门笔记1—ggplot2简要教程 1. 设置 The Setup 2. 图层 The Layers 3. 标签 The Labels 4. 主题 The Theme 5. 分面 The Facets 6. 常用函数 Commonly Used Features 6.1 绘制时间序列图(使用ggfortify) 6.2 在同一ggplot上绘制多个时间序列 6.3 条形图 6.4 自定义布局 6.5 翻转坐标轴 6.6 调整...