ggplot(data = mydata, aes(x,y,color=cluster)) + geom_point (alpha=0.2)+ # 绘制透明度为0.2 的散点图 stat_ellipse(aes(x=x,y=y,fill= cluster), geom="polygon", level=0.95, alpha=0.2)+#绘制椭圆标定不同类别 scale_color_manual(values=c("#00AFBB","#FC4E07"))+#使用不同颜色标定不...
R语言ggplot2如果要做散点图可以用自带的一些形状 如果想用其他形状,有一个R包是ggstar https://cran.r-project.org/web/packages/ggstar/vignettes/ggstar.html 如果还想用其他形状,可以修改ggstar的代码,来增加一些形状。ggstar这个R包的整体结构暂时还看不明白,但是定义形状的部分自己能够修改。 在primitive.R...
p2 <-ggplot(mpg, aes(cyl, hwy)) + geom_jitter(width = 0.25)plot_grid(p1, p2, labels = LETTERS[1:2], ncol = 2) 设置较大的width或height完全消除离散性 p3 <- ggplot(mpg, aes(cty, hwy)) + geom_jitter() p4 <- ggplot(mpg, aes(cty, hwy)) + geom_jitter(width = 0.5, height ...
ggmap:提供Google Maps,Open Street Maps等流行的在线地图服务模块 ggiraph:绘制交互式的ggplot图形 ggstance:实现常见图形的横向版本 GGally:绘制散点图矩阵 ggalt:添加额外的坐标轴,geoms等 ggforce:添加额外geoms等 ggrepel:用于避免图形标签重叠,美化ggplot; ggraph:用于绘制网络状、树状等特定形状的图形,用于绘制网络...
使用ggplot2,进行绘制散点图,ggplot()函数中绘图数据集为 df,映射 aes()中 x 轴为企鹅嘴长数据,y 轴为企鹅嘴宽数据,按照不同种类来区分颜色;几何形状使用 geom_point()设置为点,用于绘制散点图,散点大小设置为 3。有了绘图数据、映射和几何形状,即可完成绘制一幅基础图形,将图形保存为 p1。
ggplot2包中绘制点图的函数有两个:geom_point和 geom_dotplot,当使用geom_dotplot绘图时,point的形状是dot,不能改变点的形状,因此,geom_dotplot 叫做散点图(Scatter Plot),通过绘制点来呈现数据的分布,对点分箱的方法有两种:点密度(dot-density )和直方点(histodot)。当使用点密度分箱(bin)方式时,分箱的位...
R语言ggplot2包可供选择的形状(shape)如图3-1-9所示,总共20种不同类型的形状,而Origin软件中可供选择的形状更多。Excel、Origin、Python等软件中也存在不同的形状,最常用就是圆形○、菱形◇、方形□、三角形△等。 图4-1-10多数据系列散点图 气泡图...
我们先生成一个最基本的图。 ggplot(otu_stat, aes(otu_sort, -log10(p_value))) + geom_point(aes(size = abundance, color = phylum, shape = enrich)) + scale_size(range = c(1, 5))+ theme_bw()+ scale_shape_manual(values=c("Enriched" = 17, "Depleted" = 25, "Non-signficant" ...