现在,我们可以创建一个基础的箱线图。 p<-ggplot(data,aes(x=group,y=value))+geom_boxplot()# 绘制箱线图 1. 步骤4:添加p值显著性 使用geom_signif函数,我们可以在图中添加显著性标记。comparisons参数指定我们比较的组。 p+geom_signif(comparisons=list(c("A","B")),map_signif_label=TRUE)# 添加...
最后一步是使用geom_signif函数添加显著性标记。 #添加显著性标记p <- ggplot(df, aes(x = x, y = y, color = group)) + geom_point() + # 添加散点图 geom_signif(comparisons = list(c("Group1", "Group2")), map_signif_level = TRUE) # 添加显著性标记 print(p) 1. 2. 3. 4. 5....
R2<-R+geom_signif( comparisons = list(c("A", "B")), y_position = 29, map_signif_level = F, textsize = 7, aes(annotations = c("p<0.001")), size=1,#调整横线的粗细 color = "black",#调整横线及p值文本的颜色 tip_length = c(0.15, 0.2),#调整左右竖线的长短) R2+geom_signif(...
除了使用geom_signif,还可以考虑使用ggpubr包中的stat_compare_means函数进行显著性标记。这个函数可以一次性对多组样本进行显著性检验和标记,同时还提供了多种显著性标记的显示方式。 总之,使用ggplot的geom_signif函数可以在作图过程中方便地添加显著性标记,使图表更加直观易懂。此外,还可以使用ggpubr包中的stat_comp...
最后,使用geom_signif()函数为图表添加显著性标记。其中,comparisons参数用于指定需要比较的组别,map_signif_level参数用于控制显著性水平的映射,默认为TRUE,即将P值映射为星号数量,textsize参数用于设置标记文本的字体大小,vjust参数用于调整标记文本的垂直位置。 运行上述代码,将会得到一个包含显著性标记的折线图。©...
添加显著性标记用到的是ggsignif包中的geom_signif()函数 在昨天推文的基础上,如果是利用带重复的原始数据作图,然后利用geom_signif()函数作图的时候我遇到了报错,暂时还不知道如何解决。等找到原因了再来介绍。 查找资料的过程中找到了一篇论文 https://www.jove.com/t/60139/nest-building-behavior-as-an-early...
geom_signif - 常用参数 # geom_signif()主要参数如下:geom_signif(mapping=NULL,data=NULL,stat="signif",position="identity",na.rm=FALSE,show.legend=NA,inherit.aes=TRUE,comparisons=NULL,test=wilcox.test,test.args=NULL,annotations=NULL,map_signif_level=FALSE,y_position=NULL,xmin=NULL,xmax=NULL,...
geom_point(position = position_jitter(width = 0.2), alpha = 0.5) + geom_signif(comparisons = comparisons2, test = wilcox.test, map_signif_level = T, color = "black", textsize = 4, step_increase = 0.5, y_position = 250) +
非常方便，但是无法指定添加的p值的位置，在某些时候会缺乏灵活性，今天要介绍的是另外一个R包ggsignif...