在R中使用geom_label_repel函数可以实现将标签放在前面,将引线放在后面的效果。geom_label_repel是ggplot2包中的一个函数,用于在绘图中添加标签,并自动调整标签的位置以避免重叠。 具体步骤如下: 首先,确保已经安装了ggplot2包。如果没有安装,可以使用以下命令进行安装: 代码语言:txt 复制 install.package...
使用geom_label_repel()函数添加均值文本到箱线图上: 将均值数据框与原始数据框合并(为了获取正确的标签位置,这里采用一个稍微复杂的方法,即先绘制一个不可见的点图层,然后在这个图层的基础上添加标签),并使用geom_label_repel()函数添加标签。 R # 为了在正确的位置添加标签,先绘制一个不可见的点图层 p <...
geom_point(data=muy,aes( alpha=0.7,size = MOI)) +scale_color_viridis(discrete=T,option = "C",begin = 0,end=0.8,direction = -1) + theme_ipsum() + geom_text(aes(x=day,y=MOI,label=MOI)) 从图可以看到由于有数据重复或者相近,文本出现叠加。 三、使用geom_label_repel函数 这里我直接将...
到这儿,文本注释算加完了,线段的方向还不是很满意,有些杂乱文章。 这个包里面的另一个函数geom_label_repel,可以加文本框,参数和geom_text_repel类似, p+ggrepel::geom_label_repel( aes(label=gene),df2 ) ggsave("tmp5.pdf",width = 22, height = 20, units = c("cm")) 需要注意的是,文本框会...
geom_label_repel() 代码语言:javascript 复制 geom_label_repel(fill="white",xlim=c(-Inf,Inf),ylim=c(-Inf,Inf)) 此外,还有更多功能强大的函数,部分可视化效果如下: 03. Python-adjustText简介 adjustText(https://github.com/Phlya/adjustText)作为matpotlib 文本标注的辅助库,其设计灵感来源于 R-ggrepe...
geom_point() + geom_text_repel(aes(label = label)) + theme(text = element_text(face = "italic")) 1. 2. 3. 4. 在上面的代码中,我们添加了一个theme函数,并使用element_text函数修改了文本的字体属性。通过将face参数设置为"italic",我们可以将文本标签的字体样式更改为斜体。
最后,像plot的画法一样,我们可能还需要highlight top的一些candidates,比如上调或者下调top5,并显示其名字。主要通过geom_label_repel函数来控制。 我们需要先挑出top的gene。挑选方法,我们用R里面的%>%通道符来实现。 data %>%filter(regulate == 'Up') %>%arrange(pvalue,desc(abs(log2FoldChange))) %>%...
p2 <- p1 + geom_text_repel( data = subset(data, data$FDR < cut_off_FDR & abs(data$log2FC) >= cut_off_log2FC),# 可以设置跟上面不同的阈值,用数值替换即可 aes(label = gene_name), size = 3, box.padding = unit(0.5, "lines"), ...
1、数据：作图用的原始数据，包含在 ggplot() 函数中。2、几何图形 geom_() :表示数据的几何形状。3...
# 2. 外圈注释1,标签,在每类分支附近,背景颜色是Form的分类p1=p+geom_label_repel(data=subset(tree_df,node%in%phy_nodes),mapping=aes(x=x,y=y,label=Form,fill=Form),color="black",alpha=0.7)+scale_fill_manual