R语言绘制花瓣图flower plot R语言中有很多现成的R包,可以绘制venn图,但是最多支持5组,当组别数大于5时,venn图即使能够画出来,看上去也非常复杂,不够直观; 在实际的数据分析中,组别大于5的情况还是经常遇到的,这是就可以考虑用花瓣图来进行数据的可视化 比如下面这个例子: 来源于该链接 https://www.researchgate...
sample_id为数据第一行样品名;otu_num为每个样品所独有的otu数目;core_num为所有样品所共有的otu数目。 flower plot花瓣图函数的构建 ellipse_col<-c('#6181BD4E','#F348004E','#64A10E4E','#9300264E','#464E044E','#049a0b4E')#椭圆的颜色设置flower_plot<-function(sample,otu_num,core_otu,s...
R语言|绘制花瓣图(Flower plot) 今天小编来给大家介绍介绍韦恩图的升级版--花瓣图,二者本质上区别不大,只不过花瓣图可以展示更多分组(超过5组)共有和特有的元素,而韦恩图展示的分组数一般不超过5组。实际上,在画图的过程当中,当分组数超过5组之后,韦恩图就自动升级成了花瓣图。 上篇推文给大家推荐了几个R包...
然后运行脚本,R将生成并保存一个名为flower_plot.png的花瓣图图片。 5. 调整和优化 根据需要,你可以调整椭圆的大小、颜色、旋转角度等参数来优化花瓣图的展示效果。此外,还可以根据需要添加更多的文本标签、图例或其他图形元素来增强图表的可读性和信息量。
flower_plot(sample = sample_id, otu_num = otu_num, core_otu = core_num, start = 90, a = 0.5, b = 2, r = 1, ellipse_col = ellipse_col, circle_col = 'white') dev.off() ## 7.成果展示 结尾语: 本次我们的维恩图系列就算完成了,希望对大家有帮助,大家可以通过“跑”(运行)别人...
R语言sunflowerplot位于graphics包(package)。 说明 多个点被绘制为具有多个叶子的‘sunflowers’ (‘petals’),这样过度绘制是可视化的,而不是偶然和不可见的。 用法 sunflowerplot(x,...)## Default S3 method:sunflowerplot(x, y =NULL, number, log ="", digits =6, ...
绘制韦恩图(Venn plot)和花瓣图(Flower plot)的几个常用R包及在线网站 我的代码一 library (VennDiagram) venn_dir="~/Venn" venn.diagram(x= list(Group1=na.omit(pc_list),Group2=na.omit(mRNA_list,Group3=na.omit(lnc_list)), filename = paste0(venn_dir,"/results.png"), height = 1000, ...
韦恩图2-5维度,优选VennDiagram包或ggVennDiagram包,5-10维可选择upsetR包,大于10维考虑花瓣图,即网络上可找到的flower_plot函数。若需要其他变种,可以考虑VennDetail或韦恩网络图。 文案:微生物产品部 排版:市场部 联系我们 了解更多 了解更多产品信息
flower_plot(A, A.data, 90, 0.5, 2, 1, 123, ellipse_col = A.col) dev.off() 如上,供大家参考。另外plotrix包也是一个用途很广泛的R包。像双坐标轴、断层柱状图等都可以用它来绘制。 参考文章: 1.https://www.cnblogs.com/xudongliang/p/7884667.html...
plot(x) 以x的元素值为纵坐标、以序号为横坐标绘图plot(x,y) x(在x-轴上)与y(在y-轴上)的二元作图sunflowerplot(x,y)同上,但是以相似坐标的点作为花朵,其花瓣数目为点的个数pie(x)饼图boxplot(x)盒形图(“box-and-whiskers”)stripchart(x)把x的值画在一条线段上,样本量较小时可作为盒形图的替...