At this point, I'm stumped. I suspect it has something to do with the antivirus temporarily locking the file/directory after download, but I can't do anything about it from that end. TheSys.sleep(2)seems to do the trick, but I can't keep doing that before every package install ...
type="CRAN") InstallPackageFun(packages=packages_biocond , type="bioconductor")高效方式二 除了...
Here is my command: install.packages("phyloseq",dependencies=TRUE) Here is the warning: Warning in install.packages : dependency ‘igraph’ is not available Here I try to load the package I want:library("phyloseq") Here is the warning: Error: package or namespace load failed ...
[R] Warning message: In install.packages("arrow") : installation of package ‘arrow’ had non-zero exit status [R] Warning message: In install.packages("arrow") : installation of package ‘arrow’ had non-zero exit status Hello, I am trying to use thefeatherlibrary within an R-script w...
大版本更新完,例如从Catalina到Big Sur,可以删除之前的Command Line Tools目录,然后从新下载。保证Command Line Tools最新,和系统相匹配 2. 安装 R packages 通常我们使用 install.packages("package name") 来安装R包,但是使用该命令会默认从库中下载对应的Package source版本。其中,由于MAC OSX使用的编译器不是c++...
使用install.packages或BiocManager::install函数安装来源你不同的R包; 用lapply分别加载R包,并不输出加载过程中产生的信息。 packages_CRAN<-c("tidyverse","ggplot2","dplyr","tidyr")packages_biocond<-c("DESeq2","gsva")InstallPackageFun<-function(packages=packages_CRAN,type="CRAN"){#packages=packages...
OS X 操作系统,要装好 command-line-tools,如果你没有装过的话,Terminal 运行 git 或者 xcode-select 应该会弹出安装提示,按提示安装即可。 安装devtools 安装包:打开 R 环境,运行 install.packages('devtools',dependencies=T) 。 1. 准备R函数:有一个编辑代码的程序,比如说 Sublime Text,notepad++,请不要用...
ERROR: compilation failed for package 经常出现在OSX中的一个问题,缺少C++ library 提供的放头文件。解决办法是安装C++或者Xcode Command Line Tools。C++的安装不必说,Xcode Command Line Tools 的安装命令为: xcode-select --install 安装Xcode Command Line Tools 就不会在发生 compilation failed for package 的...
当我尝试运行clang命令时,会得到以下错误: xcode-select: Failed to locate 'clang', requesting installation of command line developer tools. 然后我得到了一个错误: "clang“命令需要命令行开发工具。你想现在安装这些工具吗? 如果我点击“安装”,我会继续得到同样的错误。我试过了:xcode-select --install ...
这两天在安装SingleR 包的时候总是出现编译问题,折腾了一天发现该包是依赖c++14进行编译的,课题组的服务器中的g++版本低,只支持c++11编译。 一、问题描述 报错内容:其实还有一个最初的报错,但当时忘记截图了。。。 报错信息1 报错信息2 其实是这个问题我们可以在最初源码安装R时就发现,在make install编译完成后...