函数reorder.hclust()的作用是重新排列函数从hclust()获得的聚类树,使聚类树内对象的排列顺序与原始相异矩阵内对象的排列顺序尽可能一致。重排不影响聚类树的结构。函数reorder.hclust()也可以直接给距离矩阵。 当使用rect.hclust()函数为聚类簇加框时,分类组数量(参数k=)的设定可以变为融合水平值的设定(参数h=),...
#加载包: library(paletteer) library(RColorBrewer) #主要有三种颜色形式的函数: #paletteer_c:连续型配色 #paletteer_d:离散型配色 #paletteer_dynamic,即动态配色,就是说可以把一组颜色任意切分成n个颜色 #使用时,直接输入函数,按tab建,选择(包名::配色名),后面在加需要显示的颜色个数 paletteer_c(`"gg...
xlim=c(18, 60), ylim=c(0, 70)) #x轴刻度大小 你可以使用函数axis()来创建自定义的坐标轴,而非使用R中的默认坐标轴,其格式为: axis(side, at=, labels=, pos=, lty=, col=, las=, tck=, ...) #例子在下面 函数**abline()**可以用来为图形添加参考线,其使用格式为: dose <- c(20, 30...
> # Dotplot: Grouped Sorted and Colored > # Sort by mpg, group and color by cylinder > x <- mtcars[order(mtcars$mpg),] # sort by mpg > x$cyl <- factor(x$cyl) # it must be a factor > x$color[x$cyl==4] <- "red" > x$color[x$cyl==6] <- "blue" > x$color[x$cyl...
使用igraph库中的graph_from_data_frame()函数将输入数据帧转换为图形对象 使用ggraph的树形图布局,布局为'dendrogram' 主要步骤依次讲解: 创建数据 其中d1为根节点到第一层节点的数据,每一行代表一条边,比如(origin,group1)表示从节点origin到group的边,d2是第一层节点到第二层节点的数据。edges是对d1和d2的...
使用igraph库中的graph_from_data_frame()函数将输入数据帧转换为图形对象 使用ggraph的树形图布局,布局为’dendrogram’ 主要步骤依次讲解: 创建数据 其中d1为根节点到第一层节点的数据,每一行代表一条边,比如(origin,group1)表示从节点origin到group的边,d2是第一层节点到第二层节点的数据。edges是对d1和d2的...
本文介绍了如何用R画出带error bar的分组条形图。 笔者近期画了一张带error bar的分组条形图,将相关的代码分享一下。 感谢知乎网友青山屋主的建议,提示笔者要严谨区分技术重复和生物学重复,所以笔者对文章做修改后重发。如果各位有任何建议,欢迎指正。
一,布局 R绘图所占的区域,被分成两大部分,一是外围边距,一是绘图区域。 外围边距可使用par()函数中的oma来进行设置。比如oma=c(4,3,2,1),就是指外围边距分别为下边距:4行,左边距3行,上边距2行,右边距1行。很明显这个设置顺序是从x轴开始顺时针方向。这里的行是指
堆积柱形图代码数据来源 https://github.com/kaustavSen/tidytuesday/blob/master/2021/week_11.R 感兴趣的可以尝试下原始代码 我将数据整理部分的代码去掉了,直接用整理好的数据作图 代码语言:javascript 复制 library(readr)library(tidyverse)bechdel_test_df<-read_csv("bechdel_test_df.csv")bechdel_test_text<...
width =.15bars = ax.bar(angle, radii, width=width, bottom=0.0, color='blue') img_to_return = fig2img(fig) P.close(fig)returnimg_to_returnexcept:print"Sonar data error... can't graph"pass#print "finshed graph"#pil_img = fig2img(fig)#sonar_image = pil_img#print type(pil_img...