boxplot(x1~sex.f*smokestatus.f,data=dataset,col=c("gold","darkgreen"),varwidth=TRUE,main="Boxplot group by smoke status",xlab="status",notch=TRUE) 其中,M代表男性,F代表女性; n代表从不吸烟,c代表仍在吸烟,q代表已戒烟。 我们可以看到生成了6个箱图,它们分别是三种吸烟状态(smokestatus)两个...
#定义boxplot的函数myboxplot<-function(x,col=NULL,xlab,pvalue="auto"){boxplot(x,axes=FALSE,col=col)axis(1,at=1:2,labels=FALSE)text(1:2,y=par()$usr[3]-0.08*(par()$usr[4]-par()$usr[3]),srt=60,xpd=T,adj=1,labels=xlab)#srt 字体旋转角度;usr 绘图区域的用户坐标的极值。,#x...
ggplot(group, aes(type,ANKLE1,color=type))+stat_boxplot(geom = "errorbar")+geom_boxplot()+geom_jitter() #第三种简化代码 加点 #给两组添加显著性标记library(ggsignif)#加载包ggplot(group,aes(type,ANKLE1,fill=type))+geom_boxplot()+geom_signif(comparisons=list(c("Normal","Tumor")))#li...
by.y="row.names",all=F) #绘图 ggplot(df,aes(group1,value))+ geom_boxplot(aes(fill=group1...
箱形图(Box plots) 关键函数:geom_boxplot() 可自定义的关键参数 width:指定箱形图的宽度。 notch:逻辑变量,如果为TRUE,创建具有凹槽的箱形图,凹槽范围表示围绕中位数的置信区间,median ± 1.58*IQR/sqrt(n)。凹槽可用于组间比较:如果两个箱形图的凹槽不重叠,说明这两组间的中位数存在差异。 color, si...
初始化一个 ggplot 对象,使用 plotdata 数据框,并设置分组变量 Group 映射到 x 轴,指标 Index 映射到 y 轴,同时 Group 映射到颜色,用于区分不同组的颜色。 stat_boxplot(geom = "errorbar", width = 0.15): 添加一个箱线图的统计变换,这里使用 errorbar 几何对象,宽度设置为 0.15,这可能是用来表示箱线...
Create box plots in R with the boxplot function by group or for each column 🟧 Change box colors by group, add intervals or mean points
Box plot从下到上展示的是最小值,第一四分位数 (箱子的下边线)、中位数 (箱子中间的线)、第三四分位数 (箱子上边线)、最大值 一步步解析箱线图绘制 假设有这么一个基因表达矩阵,第一列为基因名字,后面几列为样品名字,想绘制下样品中基因表达的整体分布。
+ geom_text(data= group_labels, aes(x = Group, y = max(index$Simpson) *1.05, label = label), vjust =0) # 添加Tukey标签# 显示图形print(p)# 保存图形为PNG文件ggsave("boxplot_Simpson_diversity.png", plot = p, width =10, height =8, dpi =600, bg ="white") ...
numeric(dat$Group)),dat$Value, pch = 16, col = "red") ggplot绘制箱形图 绘图格式: 代码语言:javascript 复制 ggplot(dat, aes(Group,Value))+ geom_boxplot() 这里就不展示了,试试自己绘制一下。 韦恩图 数据 代码语言:javascript 复制 ###first generate the test data #a function to generate...