柱状图和箱线图的代码能理解了其实发现好多作图都是可以触类旁通的,小提琴图作为科研结果常用展示图也不可或缺,用ggplot或者vioplot。 二、基本图形 2.1 基本小提琴图 代码语言:text AI代码解释 library("vioplot") #准备数据 ToothGrowth$dose <- as.factor(ToothGrowth$dose) p <- gg
绘制方法:使用ggplot2包的geom_violin()函数绘制小提琴图,为了更好地表征数据分布,再用geom_boxplot()函数叠加一个箱线图。 绘图操作:使用科研猫提供的提琴图·R代码,只要提供几个参数即可: (1)设置用来绘图的数据文件; (2)设置小提琴的颜色,可以是red、blue、green等各种颜色,当你想绘制多种颜色时,使用“ran...
小提琴图定义: 小提琴图(Violin Plot),是一种集成了箱线图和核密度图特征的数据可视化图形,用于展示多组数据的分布情况和概率密度。 小提琴图的作用: 1.显示数据分布:小提琴图能够清晰地展示数据的分布情况,包括数据的中位数、四分位数、离群值等统计信息。通过小提琴形状的宽度和高度,可以直观地比较不同组或...
小提琴图能展示数据的分布和概率密度,它结合了箱形图和密度图的特征,能展示数据的分布形状,比箱形图在密度层面展示更好。在数据量非常大不方便一个一个展示的时候小提琴图特别适用。 一、绘制最简单的小提琴图l…
接下来,我们将详细介绍如何使用R语言实现小提琴图的绘制。 一、安装并加载必要的包 在R语言中绘制小提琴图之前,需要确保安装并加载ggplot2包,因为它提供了绘制小提琴图所需的函数和美化图形的工具。 # 安装ggplot2包 install.packages("ggplot2") 加载ggplot2包 ...
R语言中绘制小提琴图 方法1vioplot包 001、加载包 library(ggplot2)#绘图包 library(ggpubr)#基于ggplot2的可视化包,主要用于绘制符合出版要求的图形 library(ggsignif)#用于P值计算和显著性标记 library(tidyverse)#数据预处理 library(ggprism)#提供了GraphPad prism风格的主题和颜色,主要用于美化我们的图形...
小提琴图 (Violin Plot) 用于显示数据分布及其概率密度的组合图,结合了箱形图和密度图的特征,主要用来显示数据的分布形状。 对于小提琴的绘制在R中用ggplot2比较常见,也非常简单,下面简单演示如何用R绘制小提琴图,首先我们定义一个演示数据结构: library(ggplot2) ...
library(patchwork) P1+P2一、gghalves包geom_half_violin函数关键参数:side = "l":绘制半小提琴图...
Box plot从下到上展示的是最小值,第一四分位数 (箱子的下边线)、中位数 (箱子中间的线)、第三四分位数 (箱子上边线)、最大值,具体解读看这里扩增子图表解读1箱线图:Alpha多样性。 一步步解析箱线图绘制 假设有这么一个基因表达矩阵,第一列为基因名字,后面几列为样品名字,想绘制下样品中基因表达的整体分...