数据预处理非常关键。确保你的预测变量(如基因表达数据、代谢物水平等)和响应变量(通常是分类/分组信息)格式正确,无遗漏值,并且已经进行了必要的规范化或转换。 3.PLS-DA分析: 在PLS-DA中,你会使用R包中的特定函数来建立模型。这会涉及到设置参数,如预测变量矩阵和响应变量,以及确定要在模型中使用的主成分或潜...
# plotIndiv(plsda.breast, ind.names = TRUE, col = col.breast ,ellipse = TRUE) 从图中可以看到,分组a和分组b之间存在显著的差异,分组cdef之间的差异较小,分组a分组b和分组cdef间均存在显著差异。 同时,为了我们可以从数值的角度来对这些分组的差异性进行分析。 计算他们的相关矩阵: 距离矩阵 从指示变量矩...
# plotIndiv(plsda.breast, ind.names = TRUE, col = col.breast ,ellipse = TRUE) 从图中可以看到,分组a和分组b之间存在显著的差异,分组cdef之间的差异较小,分组a分组b和分组cdef间均存在显著差异。 同时,为了我们可以从数值的角度来对这些分组的差异性进行分析。 计算他们的相关矩阵: 距离矩阵 从指示变量矩...