table1(~ sex + age + ulcer + thickness | status, data=melanoma2, overall="Total") 考文献及网址: [1]https://cran.r-project.org/web/packages/table1/vignettes/table1-examples.html 真香公众号
tabe1在文章中通常用于显示baseline information,最简单但做起来费时间!R语言里的Table1中table1函数,2秒搞定! 详见 R包table1创建网页格式的描述性统计表Table 1 - 简书 (jianshu.com)
table1可内置多个三线表的形式，指定topclass参数即可，格式是Rtable1-，后面接参数有zebra、grid、times...
利用spearman相关性分析是构建共现网络的重要方法,但由于OTU table往往有成千上万行,用R自带的corr.test()函数计算较为费时,严重制约我们的分析速度。对spearman相关性分析进行并行化运行可大大节省计算时间,为此我们手写了spearman相关性分析函数来实现并行化运行。为方便讲解,本文以我们常见的OTU table 数据为例(联系...
为了加快计算速度,我们根据相关系数矩阵的计算特点,进行了并行化重写,代码如下: #otu_table行名为样点名,列名为OTU名 #threads为使用的CPU核数 #本函数默认使用‘fdr’进行P值矫正,可参考corr.test()函数的R帮助文档 network_construct <- function(otu_table,threads){ ...
我也遇到了这个问题，输出后是空白一片
搜索http://985.so/a9kb查看全部代码(目前共计50+持续新增中),也可以点击右侧【目录】,可以看到更多有趣的代码~ 接下来学习下table1包生成该表格的具体用法: table1包使用时,其中要包含在表中的变量由“+”分隔,“分层”变量(创建列)出现在条件符号“|”的右侧。
table1可内置多个三线表的形式，指定topclass参数即可，格式是Rtable1-，后面接参数有zebra、grid、times...
输入 update_html(x)，x指前文的table1即可解决