3. R语言怎么画三维PCA # 加载R包,没有安装请先安装 install.packages("包名") library(plot3D) # 读取PCA数据文件 df = read.delim("https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/PCA/data.txt",# 这里读取了网络上的demo数据,将此处换成你自己电脑里的文件 header = T, # 指定第一行...
一、安装adegenet包 通过输入以下命令,确保你有一个 R (≥3.2.1)的最新版本: R.version.string [1] "R version 4.0.2 (2020-06-22)" 然后安装带有依赖关系的adegenet: install.packages("adegent",dep=TRUE) 如果有时候你不确定软件包的版本,你可以使用: packageDescription("adegenet", fields = "Version...
来自专栏 · R语言数据分析 9 人赞同了该文章 一 引言 2022年11月世界杯开始前,重新爬取了球员数据,本文使用该次爬取的数据;对爬取的原始数据进行简单的数据清洗,并记录学习用tidymodels包执行简单的PCA分析过程及结果。 二PCA概述 PCA(Principal Component Analysis),即主成分分析方法,是一种广泛使用的数据降维算...
首先在下载pcalg包的时候,直接在RStudio下会出现包缺失的情况,我这里是提示HB包解压时出错。因此需要下载BH包,和RBGL包之后再下载pcalg包。如果还没下载pcalg的话先不急着下,把BH, RBGL都装上后最后下pcalg最省事。 下载BH用指令 install.packages("BH",repos="https://cloud.r-project.org/") R下载好后会...
3.1 基础函数绘制PCA图 plot(df_pca$x[,1], df_pca$x[,2]) AI代码助手复制代码 3.2 ggplot2 绘制PCA图 1) Species分颜色 ggplot(df_pcs,aes(x=PC1,y=PC2,color=Species))+geom_point() AI代码助手复制代码 2)去掉背景及网格线 ggplot(df_pcs,aes(x=PC1,y=PC2,color=Species))+geom_point()+...
由于作业需要用到最新版本pcalg2.7-3, 下载中出现了一些麻烦弄了很久,现在下载好了来复盘一下大家下载都会遇到一些问题。 首先在下载pcalg包的时候,直接在RStudio下会出现包缺失的情况,我这里是提示HB包解压时出错。因此需要下载BH包,和RBGL包之后再下载pcalg包。如果还没下载pcalg的话先不急着下,把BH, RBGL都装...
R语言pcalg包中的一个bug?我跟着pcalg包的那篇论文“Causal Inference Using Graphical Models with the...
r语言生信生物分析):差异分析,WGCNA,机器学习,免疫浸润分析,热图,火山图,PCA,Venn图 R语言绘图,生信绘图 包括但不限于热图 网络图,火山图,等各种图片,数据分析相关性圈图可线上指导) SPSS数据分析免疫…
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