比如,对于一个数值x,其log10变换可以使用以下公式表示: [ y = \log_{10}(x) ] 在R语言中,可以使用内置函数log10()来实现这一转化。 R语言代码示例 假设我们有一个包含一组数据的向量,以下是进行log10对数转化的代码示例: # 创建一个包含数值的向量data<-c(1,10,100,1000,10000)# 对数据进行log10对数...
# 绘制原始数据和log 10 转换后的数据的直方图hist(data,main="Raw Data",xlab="Value")hist(log_data,main="Log Transformed Data",xlab="log10(Value)") 1. 2. 3. 通过对比这两个直方图,我们可以看到log 10 转换后的数据更接近正态分布。 结论 本文介绍了R语言中log 10 函数的基本概念、使用方法以及...
对数（底为10）函数（常用对数）
言归正传,火山图是散点图的一种展现形式,一般来说,x轴为实验组基因表达量比上对照组基因表达量的倍数差异(logFC),而y轴则为实验组比对照组之后的p值或者校正后的p值【-log10(adj.p.value)】,图中一个点代表一个基因,而颜色则代表他们是显著上调还是显著下调。 那么,可想而至,绘制火山图,需要三列数据,即...
log10(m)相当于log(m,10) round (n, m)对 n 保留 m 位小数四舍五入 ceiling (n)对 n 向上取整 floor (n)对 n 向下取整 数据类型 R 语言中的最基本数据类型主要有三种: 数字:一般形式或科学计数法 逻辑:布尔型(TRUE 、FALSE) 文本:字符串String,包含在单引号或者双引号之中。
log() #自然对数 log10() #以10为底的常用对数 2.4 平方根运算sqrt(),如图所示 2.5 指数运算exp(),表示以e为底的指数运算。如图所示 2.6 三角函数的运算函数。 sin() #正弦 cos() #余弦 asin() #反正弦 acos() #反余弦 atan() #反正切
plot(log10(rel_res)~log10(rel_crAss),data=HMP) image.png 取log10以后可以看到散点分布的更加均匀了。 接下来就是对图进行美化了 按照国家分组填充颜色 代码语言:javascript 复制 cols<-c("#E69F00","#56B4E9","#009E73","#F0E442","#0072B2","#D55E00","#CC79A7")plot(log10(rel_res)...
> log(c,base = 2) [1] 2 # 自然常数e的对数 > log(a,base=exp(1)) [1] 2.302585 # 指数对数操作 > log(a^b,base=a) [1] 5 > log(exp(3)) [1] 3 比较计算: ==, >, <, !=, <=, >=,isTRUE, identical > a<-10;b<-5 ...
> ggplot(sample,aes(x=carat,y=price))+geom_point()+scale_y_log10()+stat_smooth() 第二图层添加散点;第三图层对Y轴作log10变换;第四图层添加平滑的统计变换 (5)分面 当我们想要观察某一分类变量对数据的影响情况时,仅通过shape, color区分是不够的,需要根据变量的不同取值进行分组、分别绘图。这时就...
火山图以基因表达差异倍数为X轴,差异的P或FDR(即校正P值)值为Y轴(实际上是P或FDR的-log10值,这样都是正的,P或FDR越小,即统计显著性越强,-log10值就越大)。它可以帮我们更加方便的发现最显著、差异最大的基因。 在R语言中实现火山图方式很多,今天我们主要介绍ggplot2中怎么实现火山图的绘制,其实火山图和...