曼哈顿图和QQ图是GWAS分析结果的重要部分,而相对于qqman包,CMplot包绘制的图更加美观些,下面展示的就是CMplot绘制结果 代码也很简单,小云直接放在下面了 library(CMplot) setwd("D://rstudy/ 34;)#设置工作目录 res = read.csv('hnlmmv.assoc.csv 39;, header = T) CMplot(res, plot....
QQ图(Quantile-Quantile Plots)绘制方法 QQ图R绘制教程 「样例一」:ggplot2绘制 library(tidyverse) library(ggtext) library(hrbrthemes) library(wesanderson) library(LaCroixColoR) library(RColorBrewer) library(qqplotr) library(ggsci) #构造数据 df <- data.frame(y = rt(200, df = 5)) #可视化绘制 ...
本书使用的R语言版本为4.2.3,主要使用的绘图工具包为tidyverse(2.0.0)、ggplot2(3.4.3)、ggpubr(0.6.0)、sf(1.0～14),主要数据读取及处理分析工具包为readr(2.1.4)、readxl(1.4.3)、dplyr(1.1.2)、tidyr(1.3.0)和stringr(1.5.0)等。作为免费开源的工具,R语言及其工具包的更新迭代很快,因此,读者可以...
曼哈顿图和QQ图是GWAS分析结果的重要部分,而相对于qqman包,CMplot包绘制的图更加美观些,下面展示的就是CMplot绘制结果 代码也很简单,小云直接放在下面了 library(CMplot) setwd("D://rstudy/")#设置工作目录 res = read.csv('hnlmmv.assoc.csv', header = T) ...
尔云间生信代码|R语言绘制GWAS曼哈顿图、QQ图 曼哈顿图和QQ图是GWAS分析结果的重要部分,而相对于qqman包,CMplot包绘制的图更加美观些,下面展示的就是CMplot绘制结果 代码也很简单,小云直接放在下面了 library(CMplot) setwd("D://rstudy/")#设置工作目录 res = read.csv('hnlmmv.assoc.csv', header = T) C...