记录一篇Windows安装ComplexHeatmap时遇到的各种妖魔鬼怪。 ComplexHeatmap是顾祖光博士制作的R语言包,可以绘制不同的热图,既可以实现简单热图的功能,还能绘制更为复杂的热图。复杂的热图能够有效地可视化不同数据集之间的关联并揭示潜在模式。ComplexHeatmap包提供了一种高度灵活的方式来排列多个热图并支持各种注释图形。目...
("ComplexHeatmap") BiocManager::install("DLBCL") BiocManager::install("BioNet") BiocManager::install("RSQLite") BiocManager::install("DirichletMultinomial",force = TRUE) BiocManager::install("chimeraviz") # 融合基因分析结果可视化 BiocManager::install("ballgown") # 分析转录组差异表达 BiocManager::...
colors = c("lightblue", "white", "red")) Heatmap(df, name = "dat", col = mycols) 1. 2. 3. 4. 留意Heatmap和heatmap两个包不同!前者是ComplexHeatmap的,后者是base的 若无ComplexHeatmap包需要下载: library(devtools) install.packages('riskRegression') #install_github("tagteam/riskRegressio...
(1)ComplexHeatmap死活安装不上,下载了最新的R(R 4.3.2),然后用这一句就代码就装上了:devtools::install_github("jokergoo/ComplexHeatmap")
R包相当于手机里的APP,不同的APP有不同的功能,不同的R包也有不同的功能,比如:有些R包是专门用来画热图的(pheatmap、complexheatmap等),有些R包是专门用来做生存分析(survival、survminer等)的,等。 R语言在安装时会有很多自带的R包(包括base、datasets、utils、grDevices、graphics、stats、methods),这些R包不需...
ComplexHeatmap的安装方法,如果没有安装这个R包,运行如下命令 https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/ComplexHeatmap.html 代码语言:javascript 代码运行次数:0 if(!require("BiocManager",quietly=TRUE))install.packages("BiocManager")BiocManager::install("ComplexHeatmap") ...
## 2.安装和导入R包:ComplexHeatmap ### 2.1 Bioconductor安装 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ComplexHeatmap") ### 2.2 导入R包 library(ComplexHeatmap) library(openxlsx) ...
佳名IP属地: 海南 0.062020.03.23 15:27:29字数 0阅读 3,260 BiocManager::install("ComplexHeatmap") ©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者 2人点赞 R语言 更多精彩内容,就在简书APP "小礼物走一走,来简书关注我" 赞赏支持还没有人赞赏,支持一下 ...
setwd("./ComplexHeatmap") ## 2.安装和导入R包:ComplexHeatmap ### 2.1 Bioconductor安装 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("ComplexHeatmap") ### 2.2 导入R包 library(ComplexHeatmap) ...