QuPath的官方网址放在github上: https://qupath.github.io/ QuPath使用Java语言编写。 QuPath的源代码放在github: https://github.com/qupath/qupath QuPath最初由Pete Bankhead在北爱尔兰贝尔法斯特女王大学开发,后来Jose Fernandez又进行了部分代码增写和测试。2016年10月在GitHub上发布了0.0.1-beta版,目前最新版是2024...
qupath-core-processing Add equals, hashCode & tests to ROIs Mar 25, 2025 qupath-core Merge pull request#1817from alanocallaghan/create-region-constraints Mar 27, 2025 qupath-extension-bioformats Typos Mar 11, 2025 qupath-extension-openslide ...
打开方式与打开任何图像的方式相同-将其拖到QuPath查看器上,或选择 “File->Open”命令。 无需先打开图像。如果您的原始图像保留在原来的路径或链接,.qpdata文件将自动打开它。但是,如果图像已被移动,QuPath将显示一个对话框,提示您选择新的图像位置。
1.1万 3 01:03 App Caseviewer固定尺寸视野获取 527 0 03:13 App akoya_qptiff格式图片在Qupath下的处理 6432 0 03:23 App CaseViewer免疫荧光选中注释图原图导出 46.0万 170 03:59 App 美国人日常交流的语速,你能听懂多少(232) 288 0 03:05 App akoya软件处理杂记 683 0 00:57 App image j fiji 通道...
如下所示为打开后的QuPath软件界面,通过菜单栏Extensions可以查看分割模型是否安装完成。完成上述准备工作后即可进入后续分析流程。下图展示的是QuPath中安装了Stardist插件。 2. 新建和打开对象 通过Creat Project 进行新建对象保存目录,将分析文件结果保存到空白文件夹中,如需要打开之前新建的对象可以通过Open project。
首先,打开QuPath,点击File菜单,选择Project,然后创建一个新的项目。接着,选择一个空的文件夹作为项目路径,然后打开你的样本图像。 选择适合的模式 🔍 根据你的样本染色情况,选择适合的模式。一般来说,组化染色选择Brightfield H-DAB模式就足够了。 选中所有分析位点 📍 接下来,使用TMA工具中的TMA dearrayer功能...
Qupath是英国爱⼯堡⼤学开发的一款开源病理全切⽚分析软件,以其强⼤的全切⽚浏览管理、标注、深度学习细胞分割能⼒和开放社区⽣态著称,但受限于单机版架构和对⾼plex数据的兼容性。泰⽴瑞PhenoCluster作为QuPath的插件,通过监督或⽆监督聚类算法与抗⼲扰深度学习模型,突破性实现了60+蛋⽩标记的...
qupath-core-processing Add equals, hashCode & tests to ROIs Mar 25, 2025 qupath-core Merge pull requestqupath#1817from alanocallaghan/create-region-cons… Mar 27, 2025 qupath-extension-bioformats Typos Mar 11, 2025 qupath-extension-openslide ...
QuPathhttps://qupath.github.io/) …… 然后是stardist+cellpose这两个非常著名的插件~ 相比Image J,这些软件虽然学习曲线稍陡,但根据我的使用体验,其量化结果更为准确——特别是在处理细胞密集的切片时。这也是我最终转向QuPath的主要原因。 在医学研究中,图像数据(如mIHC和病理图像)与分子数据(如单细胞转录组和...
764 0 01:31 App 病理学切片开源处理软件QuPath官方教程 7 - Save and revert 1940 0 05:10 App 病理学切片开源处理软件QuPath官方教程 5 - Brush and wand 1930 0 02:38 App 病理学切片开源处理软件QuPath官方教程 9 - Brightness, contrast & color transforms 2412 0 02:36 App 病理学切片开源处理软...